[发明专利]实现DNA序列分析中增加测序阅读长度的测定方法无效

专利信息
申请号: 200710135002.1 申请日: 2007-11-06
公开(公告)号: CN101168774A 公开(公告)日: 2008-04-30
发明(设计)人: 肖鹏峰;陆祖宏;孙啸;唐静 申请(专利权)人: 东南大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 代理人: 陆志斌
地址: 21009*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 一种实现DNA序列分析中增加测序阅读长度的测定方法:使用现有的电泳或非电泳DNA测序方法,测得待测DNA测序模板的碱基数量为5~40个碱基序列,人工合成另一段测序引物,该另一段测序引物由测序杂交定位片段及测序起点定位片段组成,该测序杂交定位片段是由A、T、C及G构成的与所述已知测序引物互补的碱基序列,测序起点定位片段由能够与A、T、C或G配对的基团构成且测序起点定位片段的整体稳定性低于测序杂交定位片段,其数量等于测得的DNA碱基序列的碱基总数;从待测DNA测序模板上去除延伸测序引物,再将另一段测序引物与待测DNA序列进行杂交;重复上述步骤,循环测定,至测得待测DNA序列。
搜索关键词: 实现 dna 序列 分析 增加 阅读 长度 测定 方法
【主权项】:
1.一种实现DNA序列分析中增加测序阅读长度的测定方法,其特征在于:步骤1:在待测DNA序列的一端连接一段公用的已知测序用于序列测引物的杂交,步骤2:使用现有的电泳或非电泳DNA测序方法,测得待测DNA测序模板的碱基数量为5~40个的第一段碱基序列,然后,根据连接于待测DNA序列一端的已知测序引物及已经测得的DNA碱基序列,人工合成另一段测序引物,该另一段测序引物由测序杂交定位片段及测序起点定位片段组成,该测序杂交定位片段是由A、T、C及G构成的与步骤1所述已知测序引物互补的碱基序列,测序起点定位片段由能够与A、T、C或G配对的基团构成且测序起点定位片段的整体稳定性低于测序杂交定位片段,其数量等于已经测得的DNA碱基序列的碱基总数,步骤3:采用变性方法,从待测DNA测序模板上,去除已与待测DNA测序模板杂交的延伸测序引物,再将由步骤2得到的新的人工合成的另一段测序引物与待测DNA序列进行杂交,重复步骤2~3,进行循环测定,直至测得全部待测DNA序列。
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