[发明专利]一种筛选基因芯片差异表达基因的方法

摘要

本发明提供一种筛选基因芯片差异表达基因的方法，涉及一种基因芯片数据分析中差异表达基因筛选的一种算法。本发明实施起来，包括如下步骤：步骤1，芯片数据的归一化处理；步骤2，建立对数比值x_ij＝μ+μ_j+ε线性模型；步骤3，计算出全局均值μ，列效应μ_j和方差σ的值；步骤4，利用μ、μ_j和σ，计算每个基因的2×ln(odd ratio)；步骤5，设定域值x²_cutoff，n，当步骤4中的2×ln(odd ratio)值大于x²_cutoff，n的基因定为差异表达基因。本发明通过建立统计模型，设计适当的统计量，最后使用假设检验的方法赋予每个基因一个显著性的概率数值，作为筛选基因的标准。该方法克服了常规的倍数法缺乏统计学基础和对算法本身敏感性与特异性难以估计的弱点。

主权项

1.一种筛选基因芯片差异表达基因的方法，其特征在于该方法包括有如下步骤：步骤1，对芯片数据进行归一化处理；步骤2，建立对数比值xij＝μ+μj+ε线性模型；步骤3，计算出全局均值μ，列效应μj和方差σ的值；步骤4，利用μ、μj和σ，计算每个基因的2×ln(odd ratio)；步骤5，设定域值χ2 cutoff，n，当步骤4中的2×ln(odd ratio)值大于χ2 cutoff，n的基因定为差异表达基因。