[发明专利]一种计算寡核苷酸基因芯片的UniGene表达量的算法无效
| 申请号： | 200710173615.4 | 申请日： | 2007-12-28 |
| 公开（公告）号： | CN101261689A | 公开（公告）日： | 2008-09-10 |
| 发明（设计）人： | 曾华宗;刘极龙 | 申请（专利权）人： | 上海敏芯信息科技有限公司 |
| 主分类号： | G06N3/12 | 分类号： | G06N3/12 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 200433上海市杨*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明提供一种计算寡核苷酸基因芯片的UniGene表达量的算法，属于生物技术领域，涉及基因芯片方面。本发明主要包括如下流程：步骤1，获得探针水平的表达值数据；步骤2，将探针集归入不同的UniGene；步骤3，以UniGene为单位，合并同一个UniGene下的探针集；步骤4，分别对每个UniGene下的所有探针进行层次聚类分析；步骤5，寻找层次聚类结果中的最大探针子集，作为该UniGene的代表探针集；步骤6，将代表探针集转化为UniGene水平的最终表达值。本发明的优点在于：该方法将多个探针集合并为一个UniGene来报告最终的表达值，综合了多个探针集的信息，相比于常规方法中单独使用一个探针集，结果更为可靠。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 计算 寡核苷酸 基因芯片 unigene 表达 算法 | ||
【主权项】：
1.一种计算寡核苷酸基因芯片的UniGene表达量的算法，其特征在于该方法包括有如下步骤：步骤1，获得探针水平的表达值数据；步骤2，将探针集归入不同的UniGene；步骤3，以UniGene为单位，合并同一个UniGene下的探针集；步骤4，分别对每个UniGene下的所有探针进行层次聚类分析；步骤5，寻找层次聚类结果中的最大探针子集，作为该UniGene的代表探针集；步骤6，将代表探针集转化为一个表达值，即为UniGene水平的最终表达值。
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