[发明专利]用于检测大肠癌的新的基因组合及其基因芯片

摘要

本发明为用于检测大肠癌的新的基因组合，该基因组合包括30个基因片段，其中第30种基因片段为质控基因。本发明还提供了应用该新的基因组的基因芯片。由于现有技术中对于大肠癌的检测只是针对其中一个或几个指标检测，特异性差、灵敏度低、准确率低。本发明针对大肠癌的30个指标设计了30个基因片段，这30个基因片段共同用来检测大肠癌，并且应用基因芯片技术，提供了一种特异性好、灵敏度高、准确率高的检测大肠癌的基因芯片。

主权项

1、用于检测大肠癌的新的基因组合，其特征为包括30个基因片段，其中的30种基因片段分别为：(1)以VIP 5’-CTCCTTGTGCTCCTGAC-3’和5’-CTGCTCCTCTTTCCATTC-3’为引物合成的长度为200bp的基因片段1；(2)以C2 5’-TGCTCCTGGACTGTTCG-3’和5’-GCTTCACTCCTGTGGGT-3’为引物合成的长度为395bp的基因片段2；(3)以Survivin 5’-AGGTGCCTGTTGAATCTG-3’和5’-GACGCTTCCTATCACTCTATT-3’为引物合成的长度为318bp的基因片段3；(4)以IL-2 5’-AAGACCCAGGGACTT-3’和5’-GGTTGCTGTCTCATCA-3’为引物合成的长度为280bp的基因片段4；(5)以Granulysin 5’-CTGCGTGATGAGGAGAAA-3’和5’-GGGTCGCAGCATT-3’为引物合成的长度为400bp的基因片段5；(6)以FAK 5’-TCCACCAAAGAAACCG-3’和5’-TCTGTGCCATCTCAATCT-3’为引物合成的长度为500bp的基因片段6；(7)以IL-1 5’-CGCCTGACAGAAACCA-3’和5’-GCGAATGACAGAGGGT-3’为引物合成的长度为300bp的基因片段7；(8)以IL-8 5’-CAGCCTTCCTGATTTC-3’和5’-AACCCTCTGCACCCA-3’为引物合成的长度为300bp的基因片段8；(9)以Cox-1 5’-ATCCAGAAACAGTGGCTCG-3’和5’-CAACCAATGGCGTG-3’为引物合成的长度为248bp的基因片段9；(10)以C-myc 5’-ACGCCGCTCGGAAGGAAT-3’和5’-TCCACCGTGACCACATCG-3’为引物合成的长度为300bp的基因片段10；(11)以VEGF 5’-CCCACCCACATACATACA-3’和5’-CCTCCCAACTCAAGTCC-3’为引物合成的长度为230bp的基因片段11；(12)以Stufen 5’-GCTGCGAAACACGATGCT-3’和5’-CTGGGCCAGTCGGCTAAT-3’为引物合成的长度为300bp的基因片段12；(13)以C10orf46 5’-TTTGGCTCCGCTTTCTCG-3’和5’-CTCCCAGTTGTTGTGGTTCT-3’为引物合成的长度为550bp的基因片段13；(14)以Ki-67 5’-TTGCCTCCTAATACGC-3’和5’-CTTCCGAAGCACCACT-3’为引物合成的长度为280bp的基因片段14；(15)以Granulysin 5’-CTGCGTGATGAGGAGAAA-3’和5’-GGGTCGCAGCATT-3’为引物合成的长度为320bp的基因片段15；(16)以TOP2B 5’-GACAATGCCCTCACC-3’和5’-CCAGGCTCCTTCTTC-3’为引物合成的长度为500bp的基因片段16；(17)以MTHFR 5’-ACCGCCGTGAACTACTGT-3’和5’-GCCTCCCTCCTCCTCTT-3’为引物合成的长度为350bp的基因片段17；(18)以PCNA 5’-CAAGGACCTCATCAACG-3’和5’-G ACTTTCTCCTGGTTTGG-3’为引物合成的长度为400bp的基因片段18；(19)以P15 5’-TGGACCTGGTGGCTACGAAT-3’和5’-GCCGCTAGGGCCTAAGTTGT-3’为引物合成的长度为200bp的基因片段19；(20)以IGF-1 5’-TGAAGAACGCAAGTAGAGG-3’和5’-AAAGGTTATGAAGGGAGG-3’为引物合成的长度为400bp的基因片段20；(21)以HIF-1α 5’-CCAGCAACTTGAGGAA-3’和5’-GGTGGGTAATGGAGACA-3’为引物合成的长度为300bp的基因片段21；(22)以FAK 5’-TCCACCAAAGAAACCG-3’和5’-TCTGTGCCATCTCAATCT-3’为引物合成的长度为600bp的基因片段22；(23)以CD44 5’-CTCCTCCCTGTCTACCCT-3’和5’-GACCTCCCTTATTTCTATC-3’为引物合成的长度为211bp的基因片段23；(24)以CyclinD2 5’-ACAGAAGTGCGAAGAAGAGG-3’和5’-TGGAGTTGTCGGTGTAAATG-3’为引物合成的长度为200bp的基因片段24；(25)以IGF-1 5’-TGAAGAACGCAAGTAGAGG-3’和5’-AAAGGTTATGAAGGGAGG-3’为引物合成的长度为500bp的基因片段25；(26)以uPA 5’-GGAACCCAGACAACCG-3’和5’-TGTAGATGGCCGCAAA-3’为引物合成的长度为400bp的基因片段26；(27)以FAP 5’-GAGTTGCCACCTCTGC-3’和5’-AGGCGACCAGCATAA-3’为引物合成的长度为200bp的基因片段27；(28)以DKFZp586G1517 5’-CACCGCTGCCAATAACT-3’和5’-CAAAGCACCTGTCACCC-3’为引物合成的长度为300bp的基因片段28；(29)P27 5’-GACCCTCCCAAACCAA-3’和5’-AGCGTCAAGGCTTCAGT-3’为引物合成的长度为600bp的基因片段29；(30)cyclinD1，Actin和GAPDH为基因片段30；其中基因片段30为质控基因。