[发明专利]一种筛选肿瘤遗传分子标记物的方法无效
申请号: | 200810030913.2 | 申请日: | 2008-03-26 |
公开(公告)号: | CN101245385A | 公开(公告)日: | 2008-08-20 |
发明(设计)人: | 李桂源;张文玲;曾朝阳;熊炜;周艳宏;李小玲;罗晓敏;范松青 | 申请(专利权)人: | 中南大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 中南大学专利中心 | 代理人: | 龚灿凡 |
地址: | 410083*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | 本发明公开了一种筛选肿瘤遗传分子标记物的方法:显微切割肿瘤组织标本;纯化提取RNA,体外转录、线性扩增合成aRNA;逆转录、二轮体外扩增制备生物素标记cRNA探针;探针与人类全基因组表达谱芯片杂交,信号扫描,输出数据,构建肿瘤纯化组织的基因表达谱;运用权重赋值算法,使用逐个剔除交叉验证对数据归一化处理,分析筛选与肿瘤相关的分子标记物。本发明结合使用高通量基因芯片、结合显微切割、线性扩增技术,构建不同病理类型、不同临床分期的肿瘤组织中肿瘤基因表达谱,为筛选不同用途的肿瘤分子标记物和潜在的肿瘤药物作用靶点提供了新的方法。 | ||
搜索关键词: | 一种 筛选 肿瘤 遗传 分子 标记 方法 | ||
【主权项】:
1.一种筛选肿瘤遗传分子标记物的方法,其特征在于包含以下步骤:(1)对肿瘤组织标本和非肿瘤组织标本进行显微切割;(2)纯化组织标本,提取纯化组织标本中的RNA;(3)体外转录、线性扩增合成aRNA,aRNA再经逆转录、二轮体外线性扩增制备生物素标记cRNA探针;(4)探针经片段化后与人类全基因组表达谱芯片杂交,信号扫描,输出数据,构建肿瘤纯化组织的基因表达谱;(5)运用权重赋值算法,逐个剔除交叉验证,对数据归一化处理,筛选与肿瘤发生、发展过程相关的分子标记物。
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