[发明专利]一种人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析方法无效
| 申请号： | 200810069934.5 | 申请日： | 2008-07-07 |
| 公开（公告）号： | CN101320405A | 公开（公告）日： | 2008-12-10 |
| 发明（设计）人： | 梁桂兆;康丽芳;梅虎;杨力;李志良 | 申请（专利权）人： | 重庆大学 |
| 主分类号： | G06F19/00 | 分类号： | G06F19/00 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 400044重*** | 国省代码： | 重庆;85 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析方法，能够用于人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析，进而设计更易裂解的肽样本，进一步开发有效的人免疫缺陷病毒蛋白酶抑制剂，包括如下步骤：a)基于主成分分析方法，建立氨基酸0D－3D信息得分矢量；b)应用氨基酸0D－3D信息得分矢量对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的结构进行表征；c)用逐步方法挑选与肽裂解密切相关的性质参数；d)应用线性判别分析方法建立裂解位点预测及特异性分析模型；e)分别以自取代检验，留一法交互检验以及外部检验三种方法验证模型的预测能力；f)对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的各位点的性质参数进行方差分析。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 免疫 缺陷 病毒 蛋白酶 裂解 预测 特异性 分析 方法 | ||
【主权项】：
1.一种人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析方法，其特征在于包括如下步骤：a)基于主成分分析方法，建立氨基酸0D-3D信息得分矢量；b)应用氨基酸0D-3D信息得分矢量对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的结构进行表征；c)用逐步方法挑选与肽裂解密切相关的性质参数；d)应用线性判别分析方法建立裂解位点预测及特异性分析模型；e)分别以自取代检验，留一法交互检验以及外部检验验证模型的预测能力；f)对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的各位点的性质参数进行方差分析。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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