[发明专利]蛋白质折叠仿真中的模蛇方法有效
申请号: | 200810209785.8 | 申请日: | 2008-12-25 |
公开(公告)号: | CN101436230A | 公开(公告)日: | 2009-05-20 |
发明(设计)人: | 张菁;陈怀友;李艳波;李松;赵明;王立伟;王海玲;于思亮;温乃锋;刘波 | 申请(专利权)人: | 哈尔滨工程大学 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 150001黑龙江省哈尔滨市南岗区南通*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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摘要: | 本发明提供的是一种蛋白质折叠仿真中的模蛇方法。(1)初始状态:是一条直线蛋白质序列;(2)开始折叠时:做波浪运动,用函数sin(t)来表示;(3)折叠后期:做短暂的直线运动,用函数x=x+t来表示;(4)完成折叠:做盘绕运动,用下面函数表示,x(t)=(C1cos(ωt)+C2sin(ωt)),其中,C和ω是系数,与蛋白质本身的性质有关。对于未知空间结构的蛋白质,可以通过本发明的拟蛇算法对蛋白质链进行中间体和最终空间结构进行预测,从而减少蛋白质空间结构测定过程中所耗费的人力,物力,同时也可以提供折叠分析供理论研究人员参考。 | ||
搜索关键词: | 蛋白质 折叠 仿真 中的 方法 | ||
【主权项】:
1、一种蛋白质折叠仿真中的模蛇方法,其特征是:(1)选取一条直线蛋白质序列;(2)做波浪运动,用函数sin(t)来表示;(3)做短暂的直线运动,用函数x=x+t来表示;(4)做盘绕运动,用下面函数表示,x(t)=(C1cos(ωt)+C2sin(ωt)),其中,C和ω是系数,与蛋白质本身的性质有关。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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