[发明专利]一种短序列映射方法及系统无效
| 申请号： | 200810218337.4 | 申请日： | 2008-12-12 |
| 公开（公告）号： | CN101430741A | 公开（公告）日： | 2009-05-13 |
| 发明（设计）人： | 阮珏;朱红梅;李瑞强;王俊;杨焕明;汪建 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因研究院 |
| 主分类号： | G06F19/00 | 分类号： | G06F19/00;C12Q1/68 |
| 代理公司： | 深圳中一专利商标事务所 | 代理人： | 张全文 |
| 地址： | 518083广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明适用于基因工程技术领域，提供了一种短序列映射方法及系统，所述方法包括下述步骤：将测序序列按预设长度前缀短串的碱基值排序；将序列片段重叠群逐个碱基切割成所述预设长度的短串；依次根据所述序列片段重叠群中所切割成的短串的碱基值在排序后的测序序列中查找相应的测序序列，建立映射关系。在本发明中，通过将测序序列按预设长度前缀短串的碱基值排序，并将序列片段重叠群逐个碱基切割成预设长度的短串，依次根据序列片段重叠群中所切割成的短串的碱基值在排序后的测序序列中查找相应的测序序列，建立映射关系，实现了用于短序组装中的一种短序列映射方法，处理时间短、效率高。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 序列 映射 方法 系统 | ||
【主权项】：
1、一种短序列映射方法，其特征在于，所述方法包括下述步骤：将测序序列按预设长度前缀短串的碱基值排序；将序列片段重叠群逐个碱基切割成所述预设长度的短串；依次根据所述序列片段重叠群中所切割成的短串的碱基值在排序后的测序序列中查找相应的测序序列，建立映射关系。
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