[发明专利]一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统无效
| 申请号： | 200810218339.3 | 申请日： | 2008-12-12 |
| 公开（公告）号： | CN101561845A | 公开（公告）日： | 2009-10-21 |
| 发明（设计）人： | 李俊;白寅琪;李瑞强;王俊;杨焕明;汪建 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因研究院;深圳华大基因科技有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/00 | 分类号： | G06F19/00;C12Q1/68 |
| 代理公司： | 深圳中一专利商标事务所 | 代理人： | 张全文 |
| 地址： | 518083广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明适用于基因工程领域，提供了一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统，所述方法包括下述步骤：将参考基因集中的所有参考基因定位到目标基因组上，构成基因拷贝座位；根据所述基因拷贝座位，将重叠的基因拷贝聚类到一起，形成模糊位点基因代表座位；根据所述模糊位点代表基因座位，利用动态规划模糊位点定位算法检测染色体的同线性同源区域。本发明实施例提供的染色体同线性同源区域的检测方法可自动检测到染色体同线性同源区域，且敏感度高，复杂度低，避免了目测时主观因素对染色体同线性同源区域检测的影响。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 染色体 线性 同源 区域 检测 方法 系统 | ||
【主权项】：
1、一种染色体同线性同源区域的检测方法，其特征在于，所述方法包括下述步骤：将参考基因集中的所有参考基因定位到目标基因组上，构成基因拷贝座位；根据所述基因拷贝座位，将重叠的基因拷贝聚类到一起，形成模糊位点基因代表座位；根据所述模糊位点代表基因座位，利用动态规划模糊位点定位算法检测染色体的同线性同源区域。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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