[发明专利]对在人类血清中指示人类肺组织的病理学状态的蛋白质的鉴定无效

专利信息
申请号: 200880113342.7 申请日: 2008-09-11
公开(公告)号: CN101836106A 公开(公告)日: 2010-09-15
发明(设计)人: R·T·斯特里佩;E·伊兹比卡;S·H·贝克 申请(专利权)人: 癌症预防和治疗有限公司
主分类号: G01N27/00 分类号: G01N27/00;B01D59/44
代理公司: 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 代理人: 罗菊华
地址: 美国印*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 鉴定在人类血清中存在的蛋白质的方法,所述蛋白质在正常个体和按照医生诊断已知患有非小细胞肺癌和哮喘的患者之间差异地表达。将来自各个群体的人类血清试样用胰蛋白酶或任何其它合适的内切蛋白酶消化,并且使用液相色谱电喷雾离子化质谱仪进行分析。比较来自各个群体的质谱数据以确定具有在正常、哮喘和肺癌群体之间显著差异地表达的表达强度的蛋白质。发现11种蛋白质具有在所述群体之间显著差异地表达的表达强度。最后,通过将所述质谱数据与具有已知蛋白质的质谱数据文库的已知数据库比较,获得11种蛋白质的特征。
搜索关键词: 人类 血清 指示 组织 病理学 状态 蛋白质 鉴定
【主权项】:
鉴定在人类血清中存在的指示人类肺组织的病理学状态的蛋白质的方法,当与来自未患有所述病理学状态的人类的血清中相同的所述蛋白质的表达水平相比时,所述蛋白质具有改变的表达水平,所述方法包括以下步骤:第一获得步骤,从不患有所述人类肺组织的所述病理学状态的人类群体获得大量人类血清;第二获得步骤,从患有哮喘的人类群体获得大量人类血清;第三获得步骤,从患有非小细胞肺癌的人类群体获得大量人类血清;暴露步骤,将在所述第一获得步骤、所述第二获得步骤和所述第三获得步骤中获得的所述人类血清暴露于消化剂,所述消化剂将在所述人类血清中的所述蛋白质裂解成可预测和定义的肽;分离步骤,从所述人类血清分离所述肽;使用液相色谱质谱仪,将来自在所述第一获得步骤、所述第二获得步骤和所述第三获得步骤中获得的各个所述大量人类血清的所述肽进行分析,所述质谱仪其中具有疏水性固定相的柱,以及流过所述柱的溶剂系统,所述溶剂系统分离所述肽,以及检测机构以产生质谱读数,所述质谱读数包括所述肽的质量和测量随着所述肽通过所述柱的时间阶段的所述肽的所述强度的图解说明;第一比较步骤,将来自在所述第一获得步骤中获得的所述人类血清的所述质谱读数与来自在所述第二获得步骤中获得的所述人类血清的所述质谱读数进行比较;第二比较步骤,将来自在所述第一获得步骤中获得的所述人类血清的所述质谱读数与来自在所述第三获得步骤中获得的所述人类血清的所述质谱读数进行比较;第三比较步骤,将来自在所述第二获得步骤中获得的所述人类血清的所述质谱读数与来自在所述第三获得步骤中获得的所述人类血清的所述质谱读数进行比较;选择步骤,选择在所述第一比较步骤、所述第二比较步骤和所述第三比较步骤中比较的所述质谱读数,其中所述质谱读数指示在以下之间相同的所述肽的基本上变化的所述强度:(a).患有所述哮喘的所述人类群体与不患有所述肺组织病的所述病理学状态的所述人类群体;(b).患有所述非小细胞肺癌的所述人类群体与不患有所述肺组织病的所述病理学状态的所述人类群体;和(c).患有所述哮喘的所述人类群体与患有所述非小细胞肺癌的所述人类的所述群体;鉴定步骤,通过从在所述选择步骤期间选择的所述质谱读数获得所述肽的特征,鉴定指示所述人类肺组织的所述病理学状态的所述蛋白质;和其中所述人类肺组织的所述病理学状态包括所述哮喘和所述非小细胞肺癌。
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