[发明专利]一种获得EST-SSR标记的方法无效
| 申请号： | 200910090407.7 | 申请日： | 2009-07-31 |
| 公开（公告）号： | CN101619357A | 公开（公告）日： | 2010-01-06 |
| 发明（设计）人： | 李文滨;赵雪;常玮;韩英鹏;滕卫丽 | 申请（专利权）人： | 东北农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12P19/34;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 | 代理人： | 关 畅 |
| 地址： | 150030黑龙*** | 国省代码： | 黑龙江;23 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种开发EST-SSR标记的方法。该方法包括如下步骤：1)获得基因组内含有简单序列重复的EST序列；2)在步骤1)得到的含有简单序列重复的EST序列中，将含有相同简单序列重复单元的EST序列归为一类；3)将步骤2)得到的同类的EST序列进行序列拼接，得到简单序列重复单元数目变异的重叠群、简单序列重复单元数目无变异的重叠群和没有形成重叠群的EST序列；4)根据步骤3)中简单序列重复单元数目变异的重叠群内简单序列重复的侧翼保守序列设计引物，再进行引物多态性检测，得到多态性引物，即为EST-SSR标记。与比常规方法相比，开发效率可提高2-4倍，减少工作量和经费消耗，从而缩短了研发时间、降低了开发成本，同时降低了错过多态性SSR位点的可能性。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 获得 est ssr 标记 方法 | ||
【主权项】：
1、一种获得EST-SSR标记的方法，包括如下步骤：1)获得基因组内含有简单序列重复的EST序列；2)在步骤1)得到的含有简单序列重复的EST序列中，将含有相同简单序列重复单元的EST序列归为一类；3)将步骤2)得到的同类的EST序列进行序列拼接，得到简单序列重复单元数目变异的重叠群、简单序列重复单元数目无变异的重叠群和没有形成重叠群的EST序列；4)根据步骤3)中简单序列重复单元数目变异的重叠群内简单序列重复的侧翼保守序列设计引物，再进行引物多态性检测，得到多态性引物，即为EST-SSR标记。
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