[发明专利]鸡内脂素基因9bp indel多态性检测方法及其应用

摘要

本发明涉及一种鸡内脂素基因9bp indel多态性检测方法及其应用，所述的检测方法包括以鸡内脂素基因9bp indel位点的位置设计引物；然后进行PCR扩增；通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测该基因9bp indel多态性，9bp缺失时为DD基因型，9bp插入时为II基因型，该位点杂合的个体为ID基因型。利用上述检测结果结合鸡经济性状进行关联分析，用于鸡的辅助选择和分子育种。本发明的检测方法无需酶切，节约成本和时间；使用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测，克服了琼脂糖电泳对小片段核苷酸差异检测的局限性；该方法不仅分辨率高，检测灵敏，判型准确，且该凝胶对染色方法也没有要求，溴化乙啶(EB)染色和银染均可。

主权项

一种鸡内脂素基因9bp indel多态性检测方法，其特征在于：所述方法包括以下步骤：(1)依据鸡内脂素基因9bp indel位点在基因组序列中的位置，以鸡内脂素基因序列设计一对引物；(2)以包含鸡内脂素基因的DNA序列为模板进行PCR扩增；(3)通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测鸡内脂素基因9bp indel多态性，当鸡内脂素基因第10内含子缺失9bp时，其PCR扩增产物为一条带，将其命名为DD基因型；当鸡内脂素基因第10内含子包含9bp的插入时，其PCR扩增产物为一条带，且比DD基因型的PCR扩增产物多9bp，将其命名为II基因型；而该位点杂合的个体，其PCR扩增产物为两条带，将其命名为ID基因型。