[发明专利]前列腺癌的筛查、预后、诊断或治疗反应的预测方法和实施所述方法的装置

摘要

本发明涉及前列腺癌的筛查或诊断或治疗处置或预后的个体预测方法，其包括收集个体输入数据(xi)、提供与疾病类型相连的风险的预测信息(y)，其特征在于输入数据包括至少一个变量或遗传类型变量的组合，例如识别被认为与疾病发展相关的遗传多态性的标记。本发明涉及前列腺癌的筛查或诊断或治疗处置或预后的个体预测装置，其包括用于用户获得个体信息数据的第一装置，至少一个在其上操作所述第一装置的第一软件界面，其特征在于其还包括使用本发明所述的方法并提供与疾病有关的风险的预测信息的软件。

主权项

一种前列腺癌的筛查或诊断或治疗处置或预后的个体预测方法，其包括收集个体输入数据(xi)，提供与疾病类型相连的风险预测信息(y)，其特征在于：‑收集代表性信息，所述代表性信息是患者的遗传信息和/或临床信息结果，以获得所述的个体数据；‑使用数据捕捉方式获得个体数据(xi)；‑通过统计学习构建至少一种模型来生成预测工具，该模型的输入变量是所述的代表性信息；遗传输入信息包括以下之中的至少一个变量或变量组合(所引用的所有核苷酸位置都符合2006年3月组装的“UCSC基因组浏览器”定义的核苷酸位置)：‑定义与4号染色体中127602673‑128447913区间的SNP rs2174183和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与2号染色体中37855761‑38126567区间的SNP rs7576160和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与2号染色体中241767109‑242119399区间的SNP rs2012385和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与17号染色体中63815611‑64165896区间的SNP rs888298和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与19号染色体中62026584‑62294837区间的SNP rs8110935和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与11号染色体中17464539‑17757162区间的SNP rs2190453和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与1号染色体210157195‑210446272区间的SNP rs2788140和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与1号染色体中149382371‑149874970区间的SNP rs3828054和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与3号染色体中116302446‑117011700区间的SNP rs1499955和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与3号染色体中69049525‑69153397区间的SNP rs4855539和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与7号染色体中27414591‑27808301区间的SNP rs11526176和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与11号染色体中99092040‑99333419区间的SNP rs7934514和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与1号染色体中236815776‑236998150区间的SNP rs6681102和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与15号染色体中38991207‑39584443区间的SNP rs6492998和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与2号染色体中113062733‑113411386区间的SNP rs2048873和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与2号染色体中12111054‑12324507区间的SNP rs4669835和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与18号染色体中23907695‑24187878区间的SNP rs12605415和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与4号染色体中39097014‑39163238区间的SNP rs749915和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与7号染色体中104002818‑104863625区间的SNP rs13226041和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与17号染色体中61335448‑62195826区间的SNP rs721429和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与16号染色体中84725899‑84776802区间的SNP rs2352946和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与6号染色体中70074721‑70679396区间的SNP rs9364048和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与2号染色体中79446556‑79664842区间的SNP rs6755695和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与19号染色体中4098195‑4506560区间的SNP rs1138253和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与10号染色体中29356293‑29651117区间的SNP rs1773842和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与14号染色体中43257771‑43665346区间的SNP rs10148742和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量；‑定义与7号染色体中47461234‑47557773区间的SNP rs10245886和/或它的一个或多个邻位相连的基因型的变量。