[发明专利]用于分析测序数据的方法和系统无效
申请号: | 200980154364.2 | 申请日: | 2009-11-24 |
公开(公告)号: | CN102272763A | 公开(公告)日: | 2011-12-07 |
发明(设计)人: | M·罗纳格希;H·A·埃尔陶基 | 申请(专利权)人: | 伊鲁米纳公司 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22 |
代理公司: | 北京市金杜律师事务所 11256 | 代理人: | 陈文平;尚继栋 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | 本技术涉及用于分析测序数据的方法和系统。特别是,描述了用于表征靶核酸同时确定靶核酸的核苷酸序列的方法和系统。某些实施方式包括通过比较靶核酸的积累核苷酸序列与参照核苷酸序列群鉴定靶核酸来源的方法和系统。 | ||
搜索关键词: | 用于 分析 序数 方法 系统 | ||
【主权项】:
一种鉴定靶核酸的来源的方法,所述方法包括以下步骤:(a)启动测序过程以确定靶核酸或其片段的核苷酸序列,由此产生靶核酸至少一部分的核苷酸序列;(b)在终止测序过程前,比较所述靶核酸至少一部分的核苷酸序列与来自指定生物的参照核苷酸序列群,从而使用指定的阈值鉴定与所述靶核酸至少一部分的核苷酸序列相匹配的参照核苷酸序列的亚群;和(c)确定所述参照核苷酸序列亚群是否允许充分鉴定靶核酸的来源,其中如果参照核苷酸序列亚群不允许充分鉴定靶核酸的来源,则继续测序过程并重复步骤(b)和(c),并且如果参照核苷酸序列亚群允许充分鉴定靶核酸的来源,则终止测序过程。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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