[发明专利]全细胞蛋白和基因相互作用网络分析系统无效
申请号: | 201010202475.0 | 申请日: | 2010-06-17 |
公开(公告)号: | CN102289432A | 公开(公告)日: | 2011-12-21 |
发明(设计)人: | 苏峰;李奇;李睿 | 申请(专利权)人: | 上海其明信息技术有限公司 |
主分类号: | G06F17/30 | 分类号: | G06F17/30 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 201210 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明是一种全细胞蛋白和基因相互作用网络,属于生物学和计算机数据库技术相结合的领域。目前常用的蛋白间相互作用数据来自于KEGG(京都基因与基因组百科全书),然而,该数据库将细胞内不同功能的信号通路分别构建网络,人为地割裂了全细胞范围的相互作用网络。本发明将解析KEGG数据库,将KEGG数据库的多种功能间相互做关系连通,并连接了所有常用蛋白相互作用数据库,共同构筑了全细胞网络分析系统。Signal-Net解构了KEGG数据库,突破了KEGG-Pathway数据库中基因间相互作用关系局限于某一Pathway的限制。因此,Signal-Net在全KEGG-Pathway数据库的范围内筛选某个蛋白的上游或下游蛋白。在此,本发明将满足数据筛选条件的基因分别构建实验组和对照组基因网络。 | ||
搜索关键词: | 细胞 蛋白 基因 相互作用 网络分析 系统 | ||
【主权项】:
一种全细胞蛋白和基因相互作用网络,解析KEGG数据库,其特征在于将KEGG数据库的多种功能间相互做关系连通,并连接了所有常用蛋白相互作用数据库,共同构筑了全细胞网络分析系统。
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