[发明专利]一种非模式生物microRNA预测的方法无效
| 申请号： | 201010210097.0 | 申请日： | 2010-06-24 |
| 公开（公告）号： | CN102268474A | 公开（公告）日： | 2011-12-07 |
| 发明（设计）人： | 曾华宗 | 申请（专利权）人： | 上海聚类生物科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;G06F19/24 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 200333 上海市*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明设计了一种预测非模式生物microRNA的方法，该方法包括如下几步流程：步骤一、从网上下载相应非模式生物基因组序列；步骤二、剔除基因组内的重复序列；步骤三、从基因组中提取出发卡环结构；步骤四、筛选去除GC含量不合适及二级结构不稳定的发卡环；步骤五、对发卡环进行预测，提取与前体microRNA特征相似的发卡环；步骤六、去掉物种间保守性较差的环部序列，并与已知所有物种的成熟体microRNA比对，获取可能存在的microRNA；步骤七、对预测结果进行统计分析。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 模式 生物 microrna 预测 方法 | ||
【主权项】：
本发明所述的一种非模式生物microRNA预测的方法，其主要特征在于：步骤一、从网上下载相应非模式生物基因组序列步骤二、剔除基因组内的重复序列步骤三、从基因组中提取出发卡环结构步骤四、筛选去除GC含量不合适及二级结构不稳定的发卡环步骤五、对发卡环进行预测，提取与前体microRNA特征相似的发卡环步骤六、去掉物种间保守性较差的环部序列，并与已知所有物种的成熟体microRNA比对，获取可能存在的microRNA。步骤七、对预测结果进行统计分析。
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