[发明专利]扁桃EST微卫星标记的筛选方法无效
| 申请号： | 201010532509.2 | 申请日： | 2010-11-04 |
| 公开（公告）号： | CN102031251A | 公开（公告）日： | 2011-04-27 |
| 发明（设计）人： | 张智俊;李亚玲;吕志江;罗淑萍 | 申请（专利权）人： | 浙江农林大学 |
| 主分类号： | C12N15/10 | 分类号： | C12N15/10;C12Q1/68 |
| 代理公司： | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人： | 周烽 |
| 地址： | 311300 *** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种扁桃EST微卫星标记的筛选方法。针对GeneBank已公布的扁桃的ESTs的序列，利用微卫星检索软件WebSat挖掘EST微卫星分子标记，并筛选出2对多态性丰富的扁桃微卫星引物序列。本发明的扁桃微卫星DNA标记用于扁桃种质资源评价、鉴定、遗传多样性的分析，遗传图谱的构建、分子辅助选择育种等研究，是一种可靠有效的分子标记。 | ||
| 搜索关键词： | 扁桃 est 卫星 标记 筛选 方法 | ||
【主权项】：
一种扁桃EST微卫星标记的筛选方法，首先利用GeneBank公布的扁桃的ESTs的序列，经冗余序列去除后，通过微卫星检索软件WebSat进行微卫星位点的查找，对于2‑6个碱基重复单元重复且重复单元序列长度大于等于18bp的微卫星进行数据挖掘与分析，从而得到含有微卫星标记的ESTs序列；然后在微卫星重复序列两端的侧翼序列设计引物，并进一步检测优化引物成为微卫星标记；最后对微卫星标记的重复性、稳定性和多态性进行综合评价，得到微卫星EST‑SSRs标记；其特征在于所筛选到的微卫星标记的特异引物分别为：AC‑SSR14：上游引物：GCAGGACCCATTTAGTTCAATC，下游引物GCCATAACAGAGACACAGAGGA；AC‑SSR62：上游引物：TCACCTTCCCTCTTACGTCAAT，下游引物：CTCTGATGTGTCGGATCTTCTG。
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