[发明专利]一种rpoB基因突变检测特异性引物和液相芯片

摘要

本发明公开了一种rpoB基因突变检测液相芯片和特异性引物，液相芯片主要包括有：5’端的tag序列和3’端针对突变位点的特异性引物组成的ASPE引物，所述特异性引物是：SEQ IDNO.21及SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28～SEQ ID NO.31中的一种以上、SEQ ID NO.32及SEQ ID NO.33、SEQ ID NO.34及SEQ ID NO.35～SEQ ID NO.36中的一种以上、SEQ ID NO.37及SEQ IDNO.38、和/或SEQ ID NO.39及SEQ ID NO.40；所述tag序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.20中的序列；分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球；扩增引物。本发明所提供的液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％。所制备的rpoB基因突变检测液相芯片具有很好的信号-噪声比，并可实现多个突变位点的并行检测。

主权项

一种rpoB基因突变检测液相芯片，其特征是，主要包括有：(A)针对rpoB基因的突变位点，分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对突变位点的特异性引物组成，所述特异性引物是：SEQ IDNO.21及SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28～SEQ ID NO.31中的一种以上、SEQ ID NO.32及SEQID NO.33、SEQ ID NO.34及SEQ ID NO.35～SEQ ID NO.36中的一种以上、SEQ ID NO.37及SEQ ID NO.38、和/或SEQ ID NO.39及SEQ ID NO.40；所述tag序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.20中的序列；(B)分别包被有特异的anti‑tag序列的、具有不同颜色编码的微球，所述anti‑tag序列选自SEQ ID NO.41～SEQ ID NO.60中的序列，所述anti‑tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对，且所述anti‑tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；(C)用于扩增具有codon513、codon 516、codon 522、codon 526、codon 529、codon 531、codon 533、和/或codon 545的突变位点的rpoB基因目标序列的扩增引物。