[发明专利]FFPE样品核酸文库,其构建方法和FFPE样品分析方法有效
| 申请号： | 201010571180.0 | 申请日： | 2010-12-02 |
| 公开（公告）号： | CN102485979A | 公开（公告）日： | 2012-06-06 |
| 发明（设计）人： | 洪雪玉;刘晓;王冠;张敏红;张秀清;杨焕明 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因科技有限公司;深圳华大基因研究院 |
| 主分类号： | C40B40/06 | 分类号： | C40B40/06;C40B50/06;C12Q1/68 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 518083 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明属于分子生物学领域，具体公开了一种FFPE样本核酸文库，其构建方法和分析FFPE样本的方法。具体的，本发明的核酸文库通过FFPE样本核酸的提取；核酸片段化；DNA片段末端修复及3’端连接“A”碱基；接头的连接及定量；片段选择；PCR扩增等步骤。本发明构建的FFPE文库能与目标序列捕获技术和测序技术相结合，为FFPE样本的分析提供了一种新的方法。 | ||
| 搜索关键词： | ffpe 样品 核酸 文库 构建 方法 分析 | ||
【主权项】：
一种FFPE样本核酸文库的构建方法，包括以下的步骤：步骤一FFPE样本核酸的提取；步骤二核酸片段化片段化的方法包括雾化、超声片段化、HydroShear或酶切处理，从而将核酸打断为大小为200‑300bp的片段；步骤三DNA片段末端修复及3’端连接“A”碱基；步骤四接头的连接将末端连接“A”碱基的DNA随机片段末端连接序列已知的接头；步骤五片段选择将连接产物进行琼脂糖电泳，选择350‑400bp进行切胶纯化；步骤六PCR扩增根据已知的接头序列设计引物，进行PCR扩增，即得到FFPE样本核酸文库。
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