[发明专利]一种感知细胞中作用转录因子的方法

摘要

本发明提供的是一种感知细胞中作用转录因子的方法。设计模型计算转录因子在基因启动子上的结合值，再分别计算转录因子在基因启动子上结合值与基因表达的相关程度值；当对特定转录因子，假定甲基化抑制转录因子结合得到的相关程度值大于不考虑甲基化作用得到的相关程度值，且考虑甲基化促进转录因子结合得到的相关程度值小于不考虑甲基化作用得到的相关程度值，则为该转录因子在该细胞中存在并对基因表达进行调控。本发明可用于判定基因启动子上转录因子的结合情况，能有效解决感知细胞中作用转录因子仅能通过实验手段导致的成本高，效率低的问题。

主权项

一种感知细胞中作用转录因子的方法，包括转录因子在基因启动子上匹配值计算，基因启动子甲基化对转录因子结合的作用描述，转录因子在基因启动子上结合值计算，转录因子在基因启动子上结合值与基因表达相关程度值计算，作用转录因子分析步骤；其特征是：分别在假定基因启动子甲基化不影响转录因子结合、甲基化抑制转录因子结合和甲基化促进转录因子结合的基础上，设计模型计算转录因子在基因启动子上的结合值，再分别计算转录因子在基因启动子上结合值与基因表达的相关程度值；当对特定转录因子，假定甲基化抑制转录因子结合得到的相关程度值大于不考虑甲基化作用得到的相关程度值，且考虑甲基化促进转录因子结合得到的相关程度值小于不考虑甲基化作用得到的相关程度值，则为该转录因子在该细胞中存在并对基因表达进行调控。