[发明专利]一种基于概率神经网络集成的信号肽预测方法无效
申请号: | 201010596731.9 | 申请日: | 2010-12-21 |
公开(公告)号: | CN102012977A | 公开(公告)日: | 2011-04-13 |
发明(设计)人: | 孔祥增;王怡;郭躬德;陈丽萍 | 申请(专利权)人: | 福建师范大学 |
主分类号: | G06F19/12 | 分类号: | G06F19/12;G06F19/24;G06N3/08 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350007 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | 本发明涉及一种基于概率神经网络集成的信号肽预测方法,其特征在于,实现步骤如下:a.根据蛋白质性质对其进行编码,然后利用滑动窗口原理分割蛋白质序列;b.建立一组概率神经网络子分类器,分别用蛋白质序列样本进行分类训练,训练后得到一组信号肽分类模型;c.利用得到的各个模型分类测试数据集;d.统计各模型输出的分类结果,产生信号肽剪切位点候选集;e.采用多数投票法决策确定信号肽的剪切位点;f.采用5折交叉验证预测结果。本发明比使用单分类器预测的准确率要高,并且算法运行速度快,算法结构简洁,能有效满足对信号肽的预测。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 概率 神经网络 集成 信号肽 预测 方法 | ||
【主权项】:
一种基于概率神经网络集成的信号肽预测方法,其特征在于,实现步骤如下:a.根据蛋白质性质对其进行编码,然后利用滑动窗口原理分割蛋白质序列;b. 建立一组概率神经网络子分类器,分别用蛋白质序列样本进行分类训练,训练后得到一组信号肽分类模型;c. 利用得到的各个模型分类测试数据集;d. 统计各模型输出的分类结果,产生信号肽剪切位点候选集;e. 采用多数投票法决策确定信号肽的剪切位点;f. 采用5折交叉验证预测结果。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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