[发明专利]用于测定抗EGFR抗体在癌症治疗中的功效的生物标记和方法

摘要

本发明涉及基于基因表达产物的生物标记和方法，用于确定抗EGFR抗体在EGFR表达性癌症的治疗中的功效。本发明进一步涉及预测患有EGFR表达性癌症的患者对用特定抗EGFR抗体进行的治疗的敏感性或抵抗性。本发明优选涉及相应生物标记的鉴定，该生物标记允许更好地预测在具有KRAS野生型肿瘤的患者中用抗EGFR抗体治疗的临床结果。在本文中，本发明特别涉及抗EGFR抗体c225/西妥昔单抗及其在患有结肠直肠癌(CRC)的患者中的用途。

主权项

一种用于预测患有KRAS野生型EGFR表达肿瘤的患者作为EGFR抗体治疗的候选者将响应以所述抗EGFR抗体进行的治疗的可能性的体外方法，所述方法包括在得自所述患者的组织样品中，通过对来自所述患者的肿瘤组织的核酸样品施用PCR或RNA或DNA阵列或相当的诊断工具或装置，测定一种或多种预后基因或其基因表达产物的表达水平，其中(i)与参考值比较，选自下组基因的基因或基因产物的高表达指示所述患者可能响应所述治疗：ADAMDEC1，BSDC1，C1orf144，CAPZB，CDC42，DHCR7，DNAJC8，ECSIT，EXOSC10，FADS1，GBA，GLT25D1，GOSR2，IMPDH1，KLHL21，KPNA6，KPNB1，LSM12，MAN1B1，MIDN，PPAN，SH3BP2，SQLE，SSH3，TNFRSF1B，URM1，ZFYVE26，RGMB，SPIRE2，ABCC5，ACSL5，AOAH，AXIN2，CD24，CEACAM5，CEACAM6，ETS2，FMNL2，GPSM2，HDAC2，JUN，ME3，MED17，MYB，MYC，NEBL，NOSIP，PITX2，POF1B，PPARG，PPP1R14C，PRR15，PSMG1，RAB15，RAB40B，RNF43，RPS23，SLC44A3，SOX4，THEM2，VAV3，ZNF337，EPDR1，KCNK5，KHDRBS3，PGM2L1，STK38，和SHROOM2，和(ii)与参考值比较，选自下组基因的基因或基因产物的高表达指示所述患者可能不响应所述治疗：C7orf46，CAST，DCP2，DIP2B，ERAP1，INSIG2，KIF21A，KLK6，NGRN，NRIP1，PHGDH，PPP1R9A，QPCT，RABEP1，RPA1，RPL22L1，SKP1，SLC25A27，SLC25A46，SOCS6，TPD52，ZDHHC2，ZNF654，ASB6，ATM，BMI1，CDC42EP2，EDEM3，PLLP，RALBP1，SLC4A11，TNFSF15，TPK1，C11orf9，C1QC，CABLES1，CDK6，EHBP1，EXOC6，EXT1，FLRT3，GCNT2，MTHFS，PIK3AP1，ST3GAL1，TK2，ZDHHC14，ARFGAP3，AXUD1，CAPZB，CHSY1，DNAJB9，GOLT1B，HSPA5，LEPROTL1，LIMS1，MAPK6，MYO6，PROSC，RAB8B，RAP2B，RWDD2B，SERTAD2，SOCS5，TERF2IP，TIAL1，TIPARP，TRIM8，TSC22D2，TGFA，VAPA，和UBE2K。