[发明专利]用于生成rRNA除尽的样本或者用于从样本分离rRNA的方法、组合物和试剂盒

摘要

本发明提供用于生成rRNA除尽的样本以及用于从样本分离rRNA的方法、组合物和试剂盒。具体地，本发明提供组合物，所述组合物包含与至少一种rRNA分子(例如28S、26S、25S、18S、5.8S和5S真核细胞质rRNA分子，12S和16S真核线粒体rRNA分子，以及23S、16S和5S原核rRNA分子)的大体上所有的rRNA分子对应的亲和标记的反义rRNA分子，并提供方法，所述方法用于利用这类组合物以生成rRNA除尽的样本或者从样本分离rRNA分子。

主权项

一种从初始样本生成rRNA除尽的样本的方法，所述方法包含：a)提供：i)包含衍生自至少一种真核生物体或者物种的RNA分子的初始样本，其中所述RNA分子包含rRNA分子和非rRNA RNA分子；ii)包含与选自25S、26S、28S、18S、5.8S和5S真核细胞质rRNA分子以及12S和16S真核线粒体rRNA分子的至少一种rRNA分子的大体上全部的序列互补的反义rRNA分子的组合物，其中所述反义rRNA分子包含亲和标记物，所述亲和标记物以所述反义rRNA分子的每10个核碱基至少一个亲和标记物的比例存在；以及iii)包含亲和标记物结合分子的结合基质；b)在一定条件下使所述初始样本接触所述包含反义rRNA分子的组合物，以便至少部分所述亲和标记的反义rRNA分子和至少部分所述rRNA分子形成双链rRNA杂交体，从而生成处理后的样本；c)在一定条件下使所述处理后的样本接触所述结合基质，其中所述亲和标记物结合分子与用于步骤b)的所述反义rRNA分子中存在的所述亲和标记物的比例是至少8比1，以便所述双链rRNA杂交体的至少部分结合至所述结合基质并得以从所述处理后的样本去除，从而生成rRNA除尽的样本，其中所述rRNA除尽的样本包含存在于所述 初始样本中的所述非rRNA RNA分子的至少部分并大体上除尽或者不含显示由所述至少一种rRNA分子显示的序列的rRNA分子。