[发明专利]一种应用于建立虚拟计算机菌株的方法和系统

摘要

一种应用于建立虚拟计算机菌株的方法和系统。为了解决现有计算机菌株设计中存在的技术问题，本发明提供了一种从最小基因组出发添加目地功能模块的方法，可以优化产物的合成路径，删去不需要的代谢途径，而提供产物的产量。且本方法摆脱了传统菌株筛选方法中对现有菌株生长特征和功能依赖的局限，通过从头设计的方法保证了对菌株性能的最优化和可控性。同时本方法不需要通过诱变筛选的方式，极大的减少了获得优质菌株的时间、人力和金钱成本。

主权项

一种应用于建立虚拟计算机菌株的方法和系统，包括以下步骤：（1）用户指定需要合成的目的产物，（2）在计算机上设计合适的最小基因组，即虚拟底盘微生物；（3）通过对目的产物代谢途径、分子通路的分析建立针对目标产物的网络模型；（4）根据步骤（3）建立的网络模型选择或者设计在工业条件下合成目的产物所需的DNA元件；（5）将DNA元件和所需的启动子等调控元件设计出功能模块；（6）将（5）中构建的功能模块插入最小基因组中，并通过优化的方法使其适配最小基因组，构建出面向目的产物的计算机菌株基因组；（7）在计算机上设计计算机程序验证该虚拟基因组的稳定性和可控性；（8）将最终稳定和可控的基因组设计模型交给用户。