[发明专利]利用环化RNase H检测基因多态性SNP位点的方法有效

专利信息
申请号: 201110040140.8 申请日: 2011-02-16
公开(公告)号: CN102181519A 公开(公告)日: 2011-09-14
发明(设计)人: 张琳;候敬丽 申请(专利权)人: 上海交通大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/44
代理公司: 上海交达专利事务所 31201 代理人: 王锡麟;王桂忠
地址: 200240 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 一种分子生物技术领域的利用环化RNase H检测基因多态性SNP位点的方法,利用转肽酶Sortase A将线性的RNase H环化、具有茎环结构的探针、待测DNA片段、待测DNA特异性的正向引物与反向引物、Vent DNA聚合酶、环化的APERNase HII,测定待测DNA片段特定位点的SNP,提高了RNase H的热稳定性。
搜索关键词: 利用 环化 rnase 检测 基因 多态性 snp 方法
【主权项】:
一种利用环化RNase H检测基因多态性SNP位点的方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤一、纯化N端含有寡聚甘氨酸、C端含有转肽酶Sortase A识别序列的线性APE RNaseHII;步骤二、环化N端含有寡聚甘氨酸、C端含有识别序列的线性APE RNase HII:转肽酶Sortase A与线性的APE RNase HII在标准反应缓冲液并温浴24h;步骤三、鉴定环化RNase H的热稳定性,环化的RNase H与未环化的RNase H经不同的温度加热处理后,鉴定其酶学活性;步骤四、合成具有茎环结构的两端含有荧光基团及淬灭基团的探针,探针5’末端及3’末端为互补序列,剩余的探针序列与待测单链DNA的SNP位点两侧核苷酸配对;步骤五、设计合成用于扩增目的DNA的特异性正向引物和反向引物,PCR扩增目的DNA;步骤六、利用合成的探针及环化的RNase H,在Steponeplus仪上进行PCR反应,测定待测单链DNA待测位点的单核苷酸多态性。
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