[发明专利]一种染色体15q25区段SNP检测的特异性引物和液相芯片

摘要

本发明公开了一种染色体15q25区段SNP检测的液相芯片和特异性引物，液相芯片主要包括有：5’端的tag序列和3’端针对目的基因SNP位点的特异性引物组成的ASPE引物，所述特异性引物是：针对染色体15q25区段A102G??SNP的SEQ??ID??NO.11和SEQ??ID??NO.12、C77T??SNP的SEQ??ID??NO.13和SEQ??ID??NO.14、C63T??SNP的SEQ??ID??NO.15和SEQ??ID??NO.16、A202C??SNP的SEQ??ID??NO.17和SEQ??ID??NO.18、和/或G139C??SNP的SEQ??ID??NO.19和SEQ??ID??NO.20；所述tag序列选自SEQ??ID??NO.1～SEQ??ID??NO.10中的序列；分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球；扩增引物。本发明所提供的液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％。所制备的染色体15q25区段SNP检测液相芯片具有很好的信号-噪声比，并可实现多个SNP位点的并行检测。

主权项

一种染色体15q25区段SNP检测的液相芯片，其特征在于，主要包括有：(A)针对每种基因的SNP位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对，每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因SNP位点的特异性引物组成；所述特异性引物是：针对染色体15q25区段A102G SNP的SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12、C77T SNP的SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.14、C63T SNP的SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.16、A202C SNP的SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18、和/或G139C SNP的SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.20；所述tag序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.10中的序列；(B)分别包被有特异的anti tag序列的、具有不同颜色编码的微球，所述anti tag序列选自SEQ ID NO21～SEQ ID NO.30中的序列，且所述anti tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对，且所述anti tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；(C)用于扩增具有染色体15q25区段的A102G、C77T、C63T、A202C和/或G139C SNP位点的目标序列的扩增引物。