[发明专利]一种基因内含子进化重构装置及方法有效
申请号: | 201110459713.0 | 申请日: | 2011-12-31 |
公开(公告)号: | CN102542178A | 公开(公告)日: | 2012-07-04 |
发明(设计)人: | 向浏欣;蔡应繁 | 申请(专利权)人: | 重庆邮电大学 |
主分类号: | G06F19/14 | 分类号: | G06F19/14 |
代理公司: | 北京同恒源知识产权代理有限公司 11275 | 代理人: | 王宗江 |
地址: | 400065 *** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | 本发明涉及一种基因内含子进化重构装置及方法,所述装置包括同源基因数据获取单元,用于获取同源基因数据;内含子位点判断单元,用于对获取的同源基因数据进行判断是否有内含子位点数据;内含子位点标定单元,用于对同源基因数据标定内含子位点;系统进化树构建单元,用于对带有内含子位点的同源基因数据集构建系统进化树;内含子进化重构单元,用于对构建的系统进化树根据最大简约法重构内含子进化;本发明在系统进化树的基础上重构内含子进化,客观地描述内含子进化历程,是后续内含子功能研究的基础,本发明对进化树的数量和每棵进化树的同源基因的数量没有限制,对同源基因内含子的任何存在形式都可以重构,具有广泛性应用前景。 | ||
搜索关键词: | 一种 基因 内含 进化 装置 方法 | ||
【主权项】:
一种基因内含子进化重构装置,其特征在于,包括:同源基因数据获取单元,用于获取同源基因数据;内含子位点判断单元,用于对获取的同源基因数据进行判断是否有内含子位点数据;内含子位点标定单元,用于对同源基因数据标定内含子位点;系统进化树构建单元,用于对带有内含子位点的同源基因数据集构建系统进化树;内含子进化重构单元,用于对构建的系统进化树根据最大简约法重构内含子进化。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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