[发明专利]利用关于基因组模型的数据集成的途径识别方法(PARADIGM)有效

专利信息
申请号: 201180032521.X 申请日: 2011-04-29
公开(公告)号: CN102985927B 公开(公告)日: 2019-03-15
发明(设计)人: C·J·瓦斯科;S·C·本茨;J·M·斯图尔特;D·豪斯勒 申请(专利权)人: 加利福尼亚大学董事会
主分类号: G16B5/00 分类号: G16B5/00
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 赵蓉民;陆惠中
地址: 美国加利*** 国省代码: 美国;US
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要: 发明涉及评估用特定临床方案或疗法治疗患者的诊断的概率的方法。
搜索关键词: 利用 关于 基因组 模型 数据 集成 途径 识别 算法 paradigm
【主权项】:
1.产生动态途径图的方法,包括:提供对储存多个途径元素的途径元素数据库的访问,每一途径元素表征为其参与至少一个途径,其中所述途径元素选自蛋白质和核酸;提供对与所述途径元素数据库连接的修正引擎的访问;利用所述修正引擎将第一途径元素与至少一个先验已知的属性关联;利用所述修正引擎将第二途径元素与至少一个假定属性关联;分别利用所述已知和假定属性,应用所述修正引擎交叉关联并指定至少一个途径的所述第一和第二途径元素的影响水平,以形成概率途径模型;和利用所述概率途径模型通过分析引擎,从样本的多个元素的多个测量的属性导出所述动态途径图,其具有特定途径的参考途径活性信息,其中所述已知属性选自化合物属性、种类属性、基因拷贝数、转录水平、翻译水平和蛋白质活性,其中所述假定属性选自化合物属性、种类属性、基因拷贝数、转录水平、翻译水平和蛋白质活性,其中所述测量的属性选自突变、差别遗传序列对象、基因拷贝数、转录水平、翻译水平、蛋白质活性和蛋白质相互作用,所述方法不用于疾病的诊断或治疗。
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