[发明专利]通过包括嵌入物分子的探针捕获目标DNA和RNA

摘要

本发明涉及一种通过包括一个或多个嵌入物分子的互补探针来特定捕获单链目标多核苷酸的技术。本发明方法进一步包括与互补探针相互作用之前去除单链目标多核苷酸中一种或多种类型的碱基。结果生成嵌入物分子可与之相互作用或插入其中的一个或多个脱碱基位点。

主权项

一种从样品中捕获目标多核苷酸的方法，包括以下步骤：i)从目标多核苷酸中去除一种或多种类型的碱基A、T、U、C或G、5‑羟甲基脱氧胞苷、5‑甲基胞嘧啶(m5C)、假尿苷(Ψ)、二氢尿苷(D)、肌苷(I)、7‑甲基鸟苷(M7G)、次黄嘌呤、黄嘌呤以及它们的2'‑O‑甲基衍生物和/或N‑甲基衍生物，从而生成一个或多个脱碱基位点，和ii)用包括一个或多个嵌入物分子的互补探针捕获所述目标多核苷酸，所述嵌入物分子插入到多核苷酸探针的骨架结构中且所述一个或多个嵌入物分子与互补多核苷酸目标序列的一个或多个脱碱基位点形态上相配；其中所述目标多核苷酸可是由天然存在的核苷酸制成，或者可由自然界中未知的核苷酸制成，或它们的任何混合物，因此所述目标多核苷酸可由选自以下的核苷酸制成：RNA、α‑L‑RNA、β‑D‑RNA、2’‑R‑RNA、DNA、锁核酸、肽核酸、吗啉寡聚体，苏糖核酸、甘油核酸、寡核苷酸N3’→P5’氨基磷酸酯、BNA、α‑L‑LNA、HNA、MNA、ANA、CAN、INA、CeNA、(2’‑NH)‑TNA、(3’‑NH)‑TNA、α‑L‑核糖‑LNA、α‑L‑木‑LNA、β‑D‑核糖‑LNA、β‑D‑木‑LNA、[3.2.1]‑LNA、二环‑DNA、6‑氨基‑二环‑DNA,5‑表二环‑DNA、α‑二环‑DNA、三环‑DNA、二环[4.3.0]‑DNA、二环[3.2.1]‑DNA、二环[4.3.0]氨酰DNA、β‑D‑吡喃核糖基‑NA、α‑L‑来苏糖基‑NA、2’‑OR‑RNA、2’‑AE‑RNA、及它们的结合物和修饰物。