[发明专利]一种字符串匹配的方法及装置无效
| 申请号： | 201210013304.2 | 申请日： | 2012-01-16 |
| 公开（公告）号： | CN102929900A | 公开（公告）日： | 2013-02-13 |
| 发明（设计）人： | 凌少平;吕雪梅 | 申请（专利权）人： | 中国科学院北京基因组研究所 |
| 主分类号： | G06F17/30 | 分类号： | G06F17/30 |
| 代理公司： | 北京同达信恒知识产权代理有限公司 11291 | 代理人： | 黄志华 |
| 地址： | 100029 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种字符串匹配的方法，用于提高匹配效率。所述方法包括：为获得的多个待匹配字符串分配不同的标识，其中一个待匹配字符串中的每个字符均对应该待匹配字符串的标识；针对多个待匹配字符串中每个待匹配字符串的每一个字符，依据BWT搜索算法，以前一个字符的坐标为起始位置与BWT空间中的目标字符串进行匹配，并在字符匹配成功时获得当前字符的坐标；依据待匹配字符串的标识，将当前获得的字符的坐标合并到对应的待匹配字符串的匹配路径中；当一个待匹配字符串中所有字符的坐标均合并时，确定该待匹配字符串与目标字符串匹配成功。本发明还公开了用于实现所述方法的装置。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 字符串 匹配 方法 装置 | ||
【主权项】：
一种字符串匹配的方法，其特征在于，包括以下步骤：为获得的多个待匹配字符串分配不同的标识，其中一个待匹配字符串中的每个字符均对应该待匹配字符串的标识；并行处理所述多个待匹配字符串，并针对每个待匹配字符串的每一个字符，依据BWT搜索算法，以前一个字符的坐标为起始位置与BWT空间中的目标字符串进行匹配，并在字符匹配成功时获得当前字符的坐标；依据待匹配字符串的标识，将当前获得的字符的坐标合并到对应的待匹配字符串的匹配路径中；当一个待匹配字符串中所有字符的坐标均合并时，确定该待匹配字符串与目标字符串匹配成功。
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