[发明专利]一种非编码基因的高通量鉴定方法有效
申请号: | 201210170788.1 | 申请日: | 2012-05-29 |
公开(公告)号: | CN102747147A | 公开(公告)日: | 2012-10-24 |
发明(设计)人: | 温俊志;廖建友;杨建华;郑凌伶;周惠;屈良鹄 | 申请(专利权)人: | 中山大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 陈卫;郝文婷 |
地址: | 510275 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种非编码基因的高通量鉴定方法,包括以下步骤:(1)提取样品总DNA,进行DNA测序,并将测序结果拼接成contig序列;(2)提取样品总RNA,从中分离长度为18~30nt的小RNA,对小RNA进行测序;(3)将小RNA测序的Reads匹配到DNA的contig序列上进行两端延伸,获得候选前体序列;(4)利用计算机软件对候选前体序列进行高通量鉴定。该发明主要针对于没有基因组图谱物种的microRNA及其基因的系统鉴定,发现新的非编码RNA基因;对已有完成基因组测序的生物同样适用;且不局限于microRNA,同样适用于具有前体结构的小RNA的检测。 | ||
搜索关键词: | 一种 编码 基因 通量 鉴定 方法 | ||
【主权项】:
一种非编码基因的高通量鉴定方法,其特征在于包括以下步骤:(1)提取样品总DNA,进行DNA测序,并将测序结果拼接成contig序列;(2)提取样品总RNA,从中分离长度为18~30nt的小RNA,对小RNA进行测序; (3) 将小RNA测序的Reads匹配到DNA的contig序列上进行两端延伸,获得候选前体序列;(4)利用计算机软件对候选前体序列进行高通量鉴定。
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