[发明专利]一种计算分子动力学动态时间步长的方法

摘要

一种计算分子动力学动态时间步长的方法，具体计算步骤如下：1）计算每两个分子之间的距离，判断数组的数值是否都大于截断半径r_c；2）计算每两个分子之间的相对速度；3）计算每两个分子之间运动到截断半径所需要的时间t(n)；4）在数组t(n)中取出最小值t_min作为下一步的时间步长。本发明的动态分子动力学模拟算法可以消除无效的计算步骤，加快了计算速度，节省了计算时间，使分子动力学模拟非聚集状态，扩展了分子动力学模拟的应用范围。

主权项

1. 一种计算分子动力学动态时间步长的方法，包括有多个分子，其特征在于，具体计算步骤如下：1）测量所有分子的坐标，计算每两个分子之间的距离，i和j为分子编号，判断数组的数值是否都大于截断半径r_c，若大于则转入步骤2），若小于则结束；2）测量所有分子的运动速度，计算每两个分子之间的相对速度；3）根据步骤1）和步骤2）中所测得的每两个分子之间的距离和速度，计算每两个分子之间运动到截断半径所需要的时间t(n)；4）在数组t(n)中取出最小值t_min作为下一步的时间步长。