[发明专利]1号染色体替换野生小家鼠品系C57BL/6.松江3‑Chr1的构建

摘要

本发明涉及1号染色体替换野生小家鼠C57BL/6.松江3‑Chr1的建立。构建了一种新的染色体C57BL/6替代实验小鼠品系，该小鼠品系的遗传背景以C57BL/6小鼠为主，但其中1号染色体以松江3小鼠为主。本发明的染色体替换品系可用于研究在相同基因组背景下，由不同的1号染色体基因组带来的性状差异，是采用遗传学方法研究染色体基因组功能的有用工具。

主权项

一种1号染色体替换实验小鼠品系C57BL/6.松江3‑Chr1的建立方法，其特征在于，所述方法包括：(1)以松江3品系雄性小鼠作为父本、C57BL/6品系雌性小鼠作为母本进行杂交，获得F1代小鼠；(2)将F1代雌性小鼠与C57BL/6品系雄性小鼠杂交，获得回交一代小鼠；该雄性回交小鼠中，Y染色体和线粒体DNA已被替换为C57BL/6品系来源的；使用多核苷酸多态性位点鉴定雄性回交小鼠的1号染色体，选择1号染色体多核苷酸多态性位点鉴定结果为松江3品系小鼠所特有的雄性回交小鼠；使用短串联重复序列位点鉴定选择到的雄性回交小鼠，选择1号染色体短串联重复序列位点鉴定结果为松江3品系小鼠所特有的回交小鼠；(3)将选择到的1号染色体短串联重复序列位点鉴定结果为松江3品系小鼠所特有的回交小鼠中雄性回交小鼠与C57BL/6品系雌性小鼠杂交，获得下一代回交小鼠，该雄性回交小鼠中，X染色体已被替换为C57BL/6品系来源的；(4)使用多核苷酸多态性位点鉴定步骤(3)获得的雄性回交小鼠的1号染色体，选择1号染色体多核苷酸多态性位点鉴定结果为松江3品系小鼠所特有的雄性回交小鼠；使用短串联重复序列位点鉴定选择到的雄性回交小鼠，选择1号染色体短串联重复序列位点鉴定结果为松江3品系小鼠所特有的雄性回交小鼠；(5)重复步骤(3)～(4)5‑50次；从而获得染色体替代动物品系，其以C57BL/6品系小鼠为背景，且其1号染色体被松江3品系小鼠的1号染色体替换；其中，所述的1号染色体的多核苷酸多态性位点包括：rs31426703，其在1号染色体上所处位置为chr1：12720994；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为C，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为T；rs32086848，其在1号染色体上所处位置为chr1：17643006；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs31928308，其在1号染色体上所处位置为chr1：28659508；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为A，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为G；rs32139742，其在1号染色体上所处位置为chr1：40806614；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs31336640，其在1号染色体上所处位置为chr1：47136503；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs6297658，其在1号染色体上所处位置为chr1：57382018；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为A，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为G；rs6302815，其在1号染色体上所处位置为chr1：69463837；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为A，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为G；rs30146639，其在1号染色体上所处位置为chr1：76144374；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs32011713，其在1号染色体上所处位置为chr1：79917356；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为C，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs6212353，其在1号染色体上所处位置为chr1：84131501；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为C，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs32662004，其在1号染色体上所处位置为chr1：98333575；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs32495825，其在1号染色体上所处位置为chr1：124737843；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs31580048，其在1号染色体上所处位置为chr1：133446374；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs30694738，其在1号染色体上所处位置为chr1：142191205；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为A，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为G；rs30902647，其在1号染色体上所处位置为chr1：150127783；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为T，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为C；rs3678938，其在1号染色体上所处位置为chr1：158391632；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs30776510，其在1号染色体上所处位置为chr1：168028380；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为T，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为G；rs32297231，其在1号染色体上所处位置为chr1：183890447；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；rs32366433，其在1号染色体上所处位置为chr1：188750111；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为C，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为T；rs31145145，其在1号染色体上所处位置为chr1：192018789；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为C，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为T；所述的1号染色体的短串联重复序列位点包括：D1MIT64，其在1号染色体上所处位置为3.7cM；在松江3品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异20bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠少10个2bp碱基重复；D1MIT236，其在1号染色体上所处位置为25.7cM；在松江3品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异10bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠少8个2bp碱基重复；D1MIT303，其在1号染色体上所处位置为32cM；在松江3品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异20bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠多10个2bp碱基重复；D1MIT49，其在1号染色体上所处位置为44cM；在松江3品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异18bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠少9个2bp碱基重复；D1MIT387，其在1号染色体上所处位置为51.5cM；在松江3品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异6bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠少3个2bp碱基重复；D1MIT445，其在1号染色体上所处位置为58cM；在松江3品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异18bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠多9个2bp碱基重复；D1MIT506，其在1号染色体上所处位置为71cM；在松江3品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异18bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠多9个2bp碱基重复；D1MIT113，其在1号染色体上所处位置为79cM；在松江3品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异22bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠多11个2bp碱基重复；D1MIT150，其在1号染色体上所处位置为81cM；在松江3品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异10bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠多5个2bp碱基重复；D1MIT209，其在1号染色体上所处位置为96cM；在松江3品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异6bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠多3个2bp碱基重复。