[发明专利]利用SSR标记快速检测低频外源染色体小片段或基因的方法

摘要

本发明公开了一种检测待测样本中是否含有目的DNA的方法。该方法包括如下步骤：将待测样本进行矩阵排列；分别作行混合和列混合；分别检测混合后样本是否含目的DNA或其等价遗传标记物；将结果阳性的混合样本对应的混合前待测样本均作标记；若结果阳性的行混合样本只有1个，和/或结果阳性的列混合样本只有1个，则标记两次的待测样本含目的DNA，其余待测样本不含目的DNA；若结果阳性的行混合样本和列混合样本均有2个以上，则分别检测标记两次的待测样本是否含目的DNA或其等价遗传标记物，结果阳性的待测样本含目的DNA，其余待测样本不含目的DNA。该方法用于植物遗传背景外源染色体片段或基因的追踪和鉴定，可节约实验成本，提高工作效率、加快实验进程。

主权项

一种检测待测样本中是否含有目的DNA的方法，包括如下步骤：（a）将N个待测样本按照如式（1）所示的矩阵A进行排列； A = a 11 a 12 · · · a 1 n a 21 a 22 · · · a 2 n · · · · · · · · · · · · a m 1 a m 2 · · · a mm 式（1）（b）混合位于所述矩阵A中每一行的所有所述待测样本，共得到m个行混合样本；混合位于所述矩阵A中每一列的所有所述待测样本，共得到n个列混合样本；（c）分别检测步骤（b）所得的m个行混合样本和n个列混合样本中是否存在所述目的DNA的等价遗传标记物；（d）将经步骤（c）检测存在所述目的DNA的等价遗传标记物的所有所述行混合样本对应的混合前所述待测样本均进行标记；将经步骤（c）检测存在所述目的DNA的等价遗传标记物的所有所述列混合样本对应的混合前所述待测样本均进行标记；（e）根据步骤（d）的标记结果，按照如下方法确定所述N个待测样本是否含有目的DNA：若经步骤（c）检测存在所述目的DNA的等价遗传标记物的所述行混合样本有且只有1个，和/或经步骤（c）检测存在所述目的DNA的等价遗传标记物的所述列混合样本有且只有1个，则步骤（d）中标记过两次的所述待测样本含有所述目的DNA或候选含有所述目的DNA，其余所有所述待测样本不含有所述目的DNA或候选不含有所述目的DNA；若经步骤（c）检测存在所述目的DNA的等价遗传标记物的所述行混合样本有2个以上，同时经步骤（c）检测存在所述目的DNA的等价遗传标记物的所述列混合样本有2个以上，则将步骤（d）中标记过两次的所述待测样本取出，分别检测是否存在所述目的DNA的等价遗传标记物，存在所述目的DNA的等价遗传标记物的所述待测样本含有所述目的DNA或候选含有所述目的DNA，其余所有所述待测样本不含有所述目的DNA或候选不含有所述目的DNA；若所有所述行混合样本经步骤（c）检测不存在所述目的DNA的等价遗传标记物，和/或若所有所述列混合样本经步骤（c）检测不存在所述目的DNA的等价遗传标记物，则所有所述待测样本不含有所述目的DNA或候选不含有所述目的DNA；其中，m和n均为3以上的整数，N等于m×n。