[发明专利]在目标基因组序列中产生新型序列的装置和方法有效

专利信息
申请号: 201210428087.3 申请日: 2012-10-31
公开(公告)号: CN103087906A 公开(公告)日: 2013-05-08
发明(设计)人: 洪侑辰;李勇锡;申守容 申请(专利权)人: 三星SDS株式会社
主分类号: C12M1/34 分类号: C12M1/34;C12Q1/68
代理公司: 北京铭硕知识产权代理有限公司 11286 代理人: 韩明星
地址: 韩国*** 国省代码: 韩国;KR
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摘要: 发明提供了在目标基因组序列中产生新型序列的装置和方法。该装置和方法用于在下一代测序(NGS)技术的基因组重测序过程中通过使用没有与参考序列比对上的输入短片段产生在参考序列中不存在的新型序列。根据本发明,产生了目标基因组序列的参考序列所未反映的新型序列,并且可以提供新型序列的信息。
搜索关键词: 目标 基因组 序列 产生 新型 装置 方法
【主权项】:
一种新型序列产生装置,包括:短片段对获得单元,获得分别包括至少一个未比对上短片段的短片段对,所述至少一个未比对上短片段根据重测序的结果而没有与参考序列比对上,重测序用于将从基因组序列测序仪接收的输入短片段与参考序列进行比对;重叠群产生单元,产生通过将所获得的短片段对的未比对上短片段进行连接而组装的重叠群;新型序列产生单元,产生包括来自产生的重叠群之中的至少一个重叠群的新型序列;以及位置预测单元,预测产生的新型序列在参考序列上的位置。
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