[发明专利]用于细胞培养基工程化的功能环境学方法

摘要

本发明涉及用于最优化细胞培养基的组成的新方法。该新方法包括两个主要阶段。在第一阶段中，通过执行特定细胞培养方案和外代谢物组测定方案，联合筛选细胞功能和介质因子（medium factor）来建立功能环境学图谱。所述功能环境学图谱由基本细胞功能的强度值相对于介质因子的数据阵列组成。在第二阶段，由所述功能环境学图谱的列（columns）开发最优化的细胞培养基制剂，所述培养基制剂增强或抑制靶标基本细胞功能。该方法的主要优势在于使得能够通过培养基组成操纵进行代谢工程化，其中通过介质因子的操纵来最优化任意高数量的细胞功能，这与主要根据经验而非细胞功能导向的并且需要多得多的实验次数的先前的方法相反。此外，该新方法基于有成本效益的外代谢物组测定且不需要花费巨大的细胞内基因组或蛋白质组学测定。

主权项

用于确定最佳细胞培养基组成的方法，其特征在于下列步骤:a)选择靶生物学结构;b)建立K个基本细胞功能的组，其设置自主的和模块化的生物学功能，其将结果一起组合成为靶标生物学结构的功能；c)建立N种介质因子的组，其决定靶标生物学结构的环境；d)使用新鲜的和/或经消耗的培养基样品的上清液的外代谢物组的实验数据建立功能环境学图谱，其表示N种介质因子的每一个对K个基本细胞功能的每一个的活化或抑制的强度；e)使用功能环境学图谱最优化定向为活化或抑制一个或多个基本细胞功能的细胞培养基的组成。