[发明专利]寡糖转移酶催化的天冬酰胺连接的糖基化的组分的合理设计有效
| 申请号： | 201280021372.1 | 申请日： | 2012-05-03 |
| 公开（公告）号： | CN103620053A | 公开（公告）日： | 2014-03-05 |
| 发明（设计）人： | M.阿伊比;K.洛彻尔;C.里扎克 | 申请（专利权）人： | 瑞士苏黎世联邦理工学院 |
| 主分类号： | C12Q1/48 | 分类号： | C12Q1/48 |
| 代理公司： | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人： | 刘健;梁谋 |
| 地址： | 瑞士*** | 国省代码： | 瑞士;CH |
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| 摘要： | 本发明涉及用于鉴定或设计用于寡糖转移酶(OST)-催化的天冬酰胺-连接(“N-连接”)的糖基化的(a)潜在寡糖供体、(b)潜在寡糖转移酶(OST)、(c)潜在共有序列基序多肽和/或(d)潜在糖基化抑制剂的方法，其包括生成红嘴鸥弯曲杆菌的寡糖转移酶(OST)的催化结构域和/或多肽结合位点的三维模型和设计或选择选自(a)至(d)的潜在组分(其优化所述一种或多种三维模型和潜在组分的立体化学互补性)的步骤。 | ||
| 搜索关键词： | 寡糖 转移酶 催化 天冬 连接 糖基化 组分 合理 设计 | ||
【主权项】：
1.用于鉴定寡糖转移酶(OST)-催化的天冬酰胺-连接(“N-连接”)的糖基化的潜在组分的方法，所述潜在组分选自(a)潜在寡糖供体，优选脂质-连接的寡糖(LLO)或焦磷酸十一异戊二烯酯结合的寡糖供体，(b)潜在寡糖转移酶(OST),(c)潜在共有序列基序多肽，和(d)潜在糖基化抑制剂，所述方法包括步骤(i)使用表1的原子坐标，所述原子坐标距离骨架原子优选+2Å、更优选+1.5Å、最优选+1.0Å均方根偏差(rmsd)，用于生成红嘴鸥弯曲杆菌的寡糖转移酶(OST)的催化结构域的三维模型，所述催化结构域包含氨基酸D56、R147、D154、D156、E319、R375、Y468、和H485中的至少三个、优选至少四个、更优选至少六个、最优选所有氨基酸，和/或，优选并且(ii)使用表1的原子坐标，所述原子坐标距离骨架原子优选+2Å、更优选+1.5Å、最优选+1.0Å均方根偏差(rmsd)，用于生成红嘴鸥弯曲杆菌的寡糖转移酶(OST)的多肽结合位点的三维模型，所述多肽结合位点包含氨基酸M318、R331、W463、W464、D465、和I572中的至少两个、优选至少三个、更优选至少四个、最优选所有氨基酸，(iii)优选在(i)和/或(ii)的三维模型的氨基酸的坐标上进行全身平移和/或旋转，(iv)使用所述(i)、(ii)和/或(iii)的三维模型用于设计或选择潜在组分(a)至(d)中的至少一种，(v)提供所述潜在组分(a)至(d)中的至少一种，并且(vi)将所述潜在组分(a)至(d)中的至少一种与对于寡糖转移酶(OST)-催化的天冬酰胺-连接(“N-连接”)的糖基化必需的进一步功能组分接触，(vii)鉴定选自以下的功能组分(A)功能性寡糖供体，优选功能性脂质-连接的寡糖(LLO)或焦磷酸十一异戊二烯酯结合的寡糖供体，(B)功能性寡糖转移酶(OST),(C)功能性共有序列基序多肽，和(D)功能性糖基化抑制剂。
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