[发明专利]筛选诱导的多能干细胞的方法

摘要

本发明提供使用认定为特异性表达于展现分化抗性的iPS细胞系的lincRNA或mRNA的标志物筛选展现分化抗性的iPS细胞的方法，和这样的标志物。

主权项

一种筛选不展现分化抗性的人诱导的多能干细胞系的方法，所述方法包含如下步骤：（i）测定选自A组和/或B组的至少一个大的基因间的非编码RNA（lincRNA）或mRNA的表达，（ii）选择其中选自A组的所述lincRNA或mRNA表达或其中选自B组的所述lincRNA或mRNA不表达的人诱导的多能干细胞系；A组由以下组成(A1)lincRNA:chr1:852245‑854050反向链，(A2)GPR177，(A3)VTCN1，(A4)lincRNA:chr1:142803013‑142804254反向链，(A5)APOA2，(A6)WNT6，(A7)EPAS1，(A8)COL3A1，(A9)SLC40A1，(A10)S100P，(A11)HOPX，(A12)GUCY1A3，(A13)CDH10，(A14)HAPLN1，(A15)PITX1，(A16)HAND1，(A17)CGA，(A18)AQP1，(A19)DLX6，(A20)DLX5，(A21)SOX17，(A22)FLJ45983，(A23)PLCE1，(A24)H19，(A25)lincRNA:chr11:2016408‑2017024反向链，(A26)lincRNA:chr11:2017517‑2017651正向链，(A27)IGF2，(A28)P2RY6，(A29)SLN，(A30)NNMT，(A31)APOA1，(A32)ERP27，(A33)LUM，(A34)CCDC92，(A35)CDX2，(A36)FLJ41170，(A37)MEG3，(A38)lincRNA:chr14:101292469‑101299626正向链，(A39)lincRNA:chr14:101295637‑101302637正向链，(A40)lincRNA:chr14:101296681‑101298460正向链，(A41)lincRNA:chr14:101298129‑101300147正向链，(A42)lincRNA:chr14:101324825‑101327247正向链，(A43)MEG8，(A44)lincRNA:chr14:101365673‑101366049正向链，(A45)lincRNA:chr14:101396955‑101397357正向链，(A46)lincRNA:chr14:101430757‑101433381正向链，(A47)lincRNA:chr14:101434059‑101436282正向链，(A48)lincRNA:chr14:101472355‑101473369正向链，(A49)DIO3，(A50)MEIS2，(A51)PRTG，(A52)C17orf51，(A53)lincRNA:chr17:21434064‑21435857反向链，(A54)lincRNA:chr17:21435180‑21454915反向链，(A55)lincRNA:chr17:21435959‑21436405反向链，(A56)CCR7，(A57)KRT23，(A58)GREB1L，(A59)GATA6，(A60)TTR，(A61)UCA1，(A62)FLRT3，(A63)lincRNA:chrX:73040495‑73047819反向链，(A64)VGLL1，(A65)RPS4Y1，(A66)DDX3Y，以及(A67)RPS4Y2，B组由以下组成(B1)DMRTB1，(B2)lincRNA:chr1:73430887‑73446112反向链，(B3)lincRNA:chr1:73444697‑73444997反向链，(B4)C4orf51，(B5)PCDHA1，(B6)lincRNA:chr6:95250854‑95263604反向链，(B7)lincRNA:chr6:14280358‑14285376反向链，(B8)lincRNA:chr6:14283301‑14285685反向链，(B9)C7orf57，(B10)lincRNA:chr7:124873114‑124899839反向链，(B11)lincRNA:chr8:129599518‑129624118反向链，(B12)OC90，(B13)lincRNA:chr8:133071643‑133092468反向链，(B14)lincRNA:chr8:133073732‑133075753反向链，(B15)HHLA1，(B16)incRNA:chr8:133076031‑133093351反向链，(B17)lincRNA:chr8:133090096‑133097869反向链，(B18)lincRNA:chr8:138387843‑138421643反向链，(B19)lincRNA:chr8:138418343‑138425831反向链，(B20)NDUFA4L2，(B21)lincRNA:chr13:54698462‑54707001反向链，(B22)ABHD12B，(B23)lincRNA:chr18:54721302‑54731677反向链，(B24)ZNF208，(B25)ZNF257，(B26)ZNF676，(B27)ZNF541，(B28)TBX1，(B29)CXorf61，以及(B30)DB090170TESTI4人类cDNA克隆TESTI40389975'，mRNA序列[DB090170]。