[发明专利]细胞识别装置以及程序有效
申请号: | 201280051541.6 | 申请日: | 2012-10-17 |
公开(公告)号: | CN103890164B | 公开(公告)日: | 2018-01-30 |
发明(设计)人: | 尾岛典行;绪方是嗣;岛圭介;田村广人;细田晃文;堀田雄大 | 申请(专利权)人: | 株式会社岛津制作所 |
主分类号: | C12M1/34 | 分类号: | C12M1/34;C12Q1/04;G01N27/62;G01N33/48 |
代理公司: | 北京林达刘知识产权代理事务所(普通合伙)11277 | 代理人: | 刘新宇 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | 在基于对被检细胞进行质量分析而得到的结果来识别该被检细胞的种类的装置中,设为以下结构设置上位DB(21)和下位DB(22),其中,该上位DB(21)收录了记载有已知细胞的构成成分的离子质量的质量列表,该下位DB(22)收录了仅记载有上述离子质量中的各菌株特有的质量的部分质量列表,首先,使用根据被检细胞的质量分析结果制作出的被检质量列表来检索上位DB(21),在基于该检索确定了在之后的检索中作为对象的生物种后,从上述被检细胞的质量列表删除上述生物种共有的质量,使用删除后的质量列表对下位DB(22)进行检索。由此,能够从遗传上亲缘相近的多个已知细胞中高精度地提取更加接近被检细胞的细胞。 | ||
搜索关键词: | 细胞 识别 装置 以及 程序 | ||
【主权项】:
一种细胞识别装置,具有存储装置和运算装置,该细胞识别装置基于对被检细胞进行质量分析而得到的结果来识别该被检细胞的种类,该细胞识别装置的特征在于,上述存储装置存储有第一数据库和第二数据库,其中,该第一数据库针对多个已知细胞收录了记载有已知细胞的构成成分的离子质量或者分子量的质量列表,该第二数据库针对多个已知细胞收录了部分质量列表,该部分质量列表中记载有已知细胞的构成成分的离子质量或者分子量中的、除该已知细胞所属的预定等级的分类群共有的离子质量或者分子量以外的离子质量或者分子量,上述运算装置具备:a)第一检索单元,其使用基于上述质量分析的结果制作出的记载有上述被检细胞的构成成分的离子质量或者分子量的被检质量列表,来检索上述第一数据库;b)分类群确定单元,其基于由上述第一检索单元得到的检索结果,将位于上述等级的分类群中的某一个确定为在之后的检索中作为对象的分类群;c)被检部分质量列表制作单元,其制作从上述被检质量列表删除由上述分类群确定单元确定的分类群共有的离子质量或者分子量所得的被检部分质量列表;以及d)第二检索单元,其使用由上述被检部分质量列表制作单元制作出的被检部分质量列表来检索上述第二数据库,并计算上述部分质量列表与上述被检部分质量列表的一致度,上述存储装置还具备变异数据库,该变异数据库收录了与在碱基序列或者氨基酸序列中可能发生的变异有关的信息,上述第二检索单元从上述变异数据库获取与变异有关的信息,基于该信息将上述第二数据库中的部分质量列表中包含的离子质量或者分子量变更为发生上述变异时的离子质量或者分子量,以该变更后的部分质量列表为对象来进行使用了上述被检部分质量列表的检索。
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