[发明专利]一种SNP位点对性状遗传效应的评价方法及应用有效
| 申请号： | 201310058894.5 | 申请日： | 2013-02-25 |
| 公开（公告）号： | CN103146821A | 公开（公告）日： | 2013-06-12 |
| 发明（设计）人： | 陈宏权;陈华 | 申请（专利权）人： | 安徽农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;G06F19/24 |
| 代理公司： | 北京双收知识产权代理有限公司 11241 | 代理人： | 王菊珍 |
| 地址： | 230036 *** | 国省代码： | 安徽;34 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种SNP位点对性状遗传效应的评价方法，包括步骤：（1）获得与需要分析的性状相关的基因片段，确定与所述性状相关的SNP位点及其基因型；（2）分析所述SNP位点与所述性状的关联性，具体计算方法如下：当所述SNP位点的数量为1时，所述SNP位点与所述性状之间的关联性为所述SNP位点的直接影响力；当所述SNP位点的数量为2个以上时，所述第i个SNP位点与性状之间的关联性为所述第i个SNP位点的直接影响力和其所有间接影响力之和。本发明解决了现有技术在筛查和评价众多SNP位点对性状的遗传效应分析方面的空白，简便易行，准确率高，分析速度快，省去了很多复杂的试验，省时省力。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 snp 性状 遗传 效应 评价 方法 应用 | ||
【主权项】：
一种SNP位点对性状遗传效应的评价方法，其特征在于：包括如下步骤：（1）获得与需要分析的性状相关的基因片段，确定与所述性状相关的SNP位点及其基因型；（2）分析所述SNP位点与所述性状直接的关联性，具体计算方法如下：当所述SNP位点的数量为1时，所述SNP位点与所述性状之间的关联性为所述SNP位点的直接影响力；当所述SNP位点的数量为2个以上时，所述第i个SNP位点与性状之间的关联性为所述第i个SNP位点的直接影响力和其所有间接影响力之和；其中，所述某个SNP位点对所述性状的直接影响力为所述性状基于SNP位点的点遗传力的平方根（hsnp）；所述第i个SNP位点通过第j个SNP位点对性状的间接影响力的计算方法为dij=rijhj，rij为所述第i个SNP位点和所述第j个SNP位点的关联度，hj为所述第j个SNP位点的直接影响力。
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