[发明专利]一种锈斑蟳微卫星分子标记的筛选方法有效

专利信息
申请号: 201310210311.6 申请日: 2013-05-30
公开(公告)号: CN103305610A 公开(公告)日: 2013-09-18
发明(设计)人: 马洪雨;夏连军;邹雄;马凌波;马春艳;陆建学;蒋伟;李淑娟;刘月星 申请(专利权)人: 中国水产科学研究院东海水产研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 上海泰能知识产权代理事务所 31233 代理人: 黄志达
地址: 200090 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明涉及一种锈斑蟳微卫星分子标记的筛选方法,包括:锈斑蟳基因组DNA的提取并稀释备用;设计5’锚定引物及PCR扩增;扩增产物的克隆及测序;序列分析及微卫星特异引物设计;使用引物对锈斑蟳不同个体的基因组DNA进行PCR扩增;使用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测PCR扩增产物;根据扩增产物的不同迁移距离确定每个个体的基因型,从而获得锈斑蟳遗传变异的多态性图谱。本发明操作简单,安全,阳性率高,结果真实可靠,可快速获得锈斑蟳遗传变异的多态性图谱。主要应用于锈斑蟳遗传变异分析及种群遗传多样性研究。
搜索关键词: 一种 锈斑 卫星 分子 标记 筛选 方法
【主权项】:
一种锈斑蟳微卫星分子标记的筛选方法,包括:(1)提取锈斑蟳基因组DNA并稀释备用;(2)设计5’锚定引物及PCR扩增;(3)克隆扩增产物及测序;(4)微卫星分子标记序列分析及微卫星特异引物设计;其中,微卫星分子标记及其对应的特异引物序列如下所示:Cfe‑1标记:如SEQ ID NO:1所示;Cfe‑1标记的特异引物序列:F:ATGCTTGCTATTATTTTCTACTG;R:GAGCAAATTAAGATTGACTGA;Cfe‑2标记:如SEQ ID NO:4所示;Cfe‑2标记的特异引物序列:F:GAGTGGTAATGGGAGCAAATG;R:TCCACATGCTCGTAAAACAAA;Cfe‑3标记:如SEQ ID NO:7所示;Cfe‑3标记的特异引物序列:F:GGGATGTAAGACAATGTGAAC;R:TTATACACCAATCTATATTAATTTC;Cfe‑4标记:如SEQ ID NO:10所示;Cfe‑4标记的特异引物序列:F:ACCAGCCGTAATGCAGAACAC;R:AAAACCCTGAGAAAGGATTGCA;Cfe‑5标记:如SEQ ID NO:13所示;Cfe‑5标记的特异引物序列:F:CTTCCCCTTGGATGACGCTC;R:GACTTAAACTCCCTTTGCTACCTG;(5)使用引物对锈斑蟳不同个体的基因组DNA进行PCR扩增;(6)使用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测PCR扩增产物;(7)根据扩增产物的不同迁移距离确定每个个体的基因型,从而获得锈斑蟳遗传变异的多态性图谱。
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