[发明专利]基于推进式决策树的中药成分及化合物肝毒评价系统无效
申请号: | 201310344934.2 | 申请日: | 2013-08-09 |
公开(公告)号: | CN104346513A | 公开(公告)日: | 2015-02-11 |
发明(设计)人: | 朱永亮;叶立;王新洲;叶祖光;金若敏;姚广涛;刘敬阁;钱向平 | 申请(专利权)人: | 苏州润新生物科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 215123 江苏省苏州市*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明提供一种中药成分及化合物肝毒的评价预测方法,该方法的步骤包括:步骤一,通过中药成分及化合物结构数据库或中药成分及化合物结构构建工具,确定待评测中药成分及化合物的化学结构;步骤二,根据该待评测中药成分及化合物的化学结构,通过系统内建的基于推进式决策树算法的中药成分及化合物肝毒预测模型对其进行肝毒毒性评价,最终得出评价预测结论。 | ||
搜索关键词: | 基于 推进 决策树 中药 成分 化合物 评价 系统 | ||
【主权项】:
一种基于推进式决策树算法的中药成分及化合物肝毒评价方法,其特征在于:(1)构建模型的肝毒基础数据既含有西药化合物,又含有中药成分;(2)采用了重采样算法结合随机森林算法选择出最优中药成分及化合物描述符集,用作中药成分及化合物的化学表征并用于构建中药成分及化合物肝毒预测模型,所述描述符包括拓扑指数、信息指数、Burden特征值和组成参数等方面;(3)使用改进的推进式决策树算法对训练集中药成分及化合物的肝毒毒性数据及其相应化学表征进行数据挖掘,得到中药成分及化合物肝毒预测模型;(4)使用改进的推进式决策树算法使用php语言开发模块化的中药成分及化合物肝毒毒性预测程序。
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G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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