[发明专利]一种基于病毒蛋白质本体的知识导航的方法、装置有效
申请号: | 201310391096.4 | 申请日: | 2013-08-30 |
公开(公告)号: | CN104424399B | 公开(公告)日: | 2018-02-23 |
发明(设计)人: | 陈恒;张珅;赵衍;张永娟;陈成材 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海生命科学研究院 |
主分类号: | G06F19/28 | 分类号: | G06F19/28 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司31100 | 代理人: | 施浩 |
地址: | 200031 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开了基于病毒蛋白质本体的知识导航的方法、装置和系统,在实现知识挖掘的基础上,创立了一种基于病毒蛋白质本体的知识导航的方法,并较好地完成了知识挖掘与知识导航功能的整合。其技术方案为本发明将知识挖掘型乙肝专题文献数据库的文本挖掘字典同乙肝病毒蛋白本体进行关联整合,并通过该关联整合,构建出一个应用于乙肝蛋白质挖掘模块的知识组织与分类导航系统,并完成基于乙肝病毒蛋白本体的知识导航功能。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 病毒 蛋白质 本体 知识 导航 方法 装置 系统 | ||
【主权项】:
一种基于病毒蛋白质本体的知识导航的方法,包括病毒知识挖掘的流程以及专题文献数据库中的蛋白质挖掘和发现的流程,其中:病毒知识挖掘的流程进一步包括:构建专题文献知识数据库和确立能够进行对应的蛋白质关联和整合的科学数据型数据库;以现存的蛋白质科学数据型数据库的标准控制词表为依据,以专题文献知识数据库中出现的病毒蛋白质名词为挖掘和发现对象,进行病毒蛋白质相关文本挖掘字典的翻译和编撰;根据国外蛋白质科学数据型数据库提供的协议将标识号转换成超链接信息,生成面向主题和应用的专题文献知识数据仓库;专题文献数据库中的病毒蛋白质本体的构建及知识导航流程包括:提取病毒相关术语;确立病毒相关术语间的关系;构建病毒蛋白本体,将知识挖掘型专题文献数据库的文本挖掘字典和病毒蛋白本体进行关联整合,并通过整合关联,构建应用于蛋白质挖掘模块的知识组织与分类导航,完成基于病毒蛋白本体的知识导航功能。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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