[发明专利]鉴定宿主基因组中HBV基因整合位点和重复靶基因有效
| 申请号： | 201310430532.4 | 申请日： | 2013-09-18 |
| 公开（公告）号： | CN103725773A | 公开（公告）日： | 2014-04-16 |
| 发明（设计）人： | 林标扬;丁东 | 申请（专利权）人： | 杭州普望生物技术有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 上海市华诚律师事务所 31210 | 代理人： | 贾师英;汤国华 |
| 地址： | 310018 浙江省*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种新颖的大规模锚定并行测序技术，其可用于分离和测序整合序列、从而鉴定宿主基因组中HBV基因整合的重复靶基因；本发明还公开了用于实施该技术的试剂盒；本发明还公开了6个新的被HBV重复整合的基因、以及相关的试剂盒。 | ||
| 搜索关键词： | 鉴定 宿主 基因组 hbv 基因 整合 重复 | ||
【主权项】：
一种用于分析HBV整合位点的大规模锚定并行测序技术，其包含如下步骤：1)从样品中提取基因组DNA；2)将步骤1)所得基因组DNA随机片段化；3)使步骤2)所得DNA片段两端与步移接头相连接，构建基因组步移文库；4)以步骤3)制备的基因组步移文库为模板，利用步移接头特异引物和HBV特异引物进行PCR扩增，得到整合子序列；5)以步骤4)所得整合子序列为模板，通过PCR反应引入与高通量测序平台兼容的接头序列，制备高通量测序文库；6)对步骤5)所得测序文库进行高通量多元测序分析；7)进行生物信息学分析，发现HBV整合位点。
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