[发明专利]用于CYP2C9和VKORC1基因芯片检测的特异性引物对和探针

摘要

本发明涉及分子生物学领域，公开了用于检测CYP2C9和VKORC1的SNP位点的特异性寡核苷酸探针，这种探针可以与CYP2C9第430位、1075位和VKORC1第-1639位不同基因型杂交。本发明还公开了检测上述SNP位点时，用于扩增CYP2C9和VKORC1基因的特异性引物对，引物对可特异性扩增CYP2C9和VKORC1基因中的含有检测目标位点的目标区域。本发明的产品可以一步完成检测CYP2C9和VKORC1的3个SNP位点基因型，为人们正确使用华法林提供信息。

主权项

一组用于检测CYP2C9和VKORC1基因SNP位点的特异性寡核苷酸探针，其特征在于，所述特异性寡核苷酸探针用于检测CYP2C9基因rs1799853的430C/T SNP位点和rs1057910的1075A/C SNP位点以及VKORC1基因rs9923231的‑1639G/ASNP位点；所述的检测位点为CYP2C9基因rs1799853的430C时，特异性寡核苷酸探针序列含有以下核苷酸序列之一：（1）SEQ ID No.1：5'‑CATTGAGGACCGTGTTCAAG‑3'；（2）SEQ ID No.2：5'‑TTGAGGACCGTGTTCAAGAG‑3'；（3）SEQ ID No.3：5'‑CATTGAGGACCGTGTTCAAGAG‑3'；所述的检测位点为CYP2C9基因rs1799853的430T时，特异性寡核苷酸探针序列含有以下核苷酸序列之一：（4）SEQ ID No.4：5'‑CATTGAGGACTGTGTTCAAGAG‑3'（5）SEQ ID No.5：5'‑ATTGAGGACTGTGTTCAAGAGG‑3'（6）SEQ ID No.6：5'‑AGCATTGAGGACTGTGTTCAAGAG‑3'；所述的检测位点为CYP2C9基因rs1057910的1075A时，特异性寡核苷酸探针序列含有以下核苷酸序列之一：（7）SEQ ID No.7：5'‑AGGTCCAGAGATACATTGACCTT‑3'（8）SEQ ID No.8：5'‑TCCAGAGATACATTGACCTTCTC‑3'（9）SEQ ID No.9：5'‑GTCCAGAGATACATTGACCTTCTCC‑3'；所述的检测位点为CYP2C9基因rs1057910的1075C时，特异性寡核苷酸探针序列含有以下核苷酸序列之一：（10）SEQ ID No.10：5'‑TCCAGAGATACCTTGACCTTCT‑3'（11）SEQ ID No.11：5'‑CAGAGATACCTTGACCTTCTCC‑3'（12）SEQ ID No.12：5'‑GTCCAGAGATACCTTGACCTTCTCC‑3'；所述的检测位点为VKORC1基因rs9923231的‑1639G时，特异性寡核苷酸探针序列含有以下核苷酸序列之一：（13）SEQ ID No.10：5'‑ACCGCACCGGGCCAAT‑3'（14）SEQ ID No.11：5'‑CGCACCGGGCCAATGGT‑3'（15）SEQ ID No.12：5'‑CACCGCACCGGGCCAAT‑3'；所述的检测位点为VKORC1基因rs9923231的‑1639A时，特异性寡核苷酸探针序列含有以下核苷酸序列之一：（16）SEQ ID No.10：5'‑CACCGCACCAGGCCAATG‑3'（17）SEQ ID No.11：5'‑ACCGCACCAGGCCAATGGT‑3'（18）SEQ ID No.12：5'‑CCACCGCACCAGGCCAAT‑3'。