[发明专利]用于对已知序列两侧未知侧翼序列测序的方法有效
申请号: | 201310656384.8 | 申请日: | 2013-12-06 |
公开(公告)号: | CN103667481A | 公开(公告)日: | 2014-03-26 |
发明(设计)人: | 林芹;李静;宋泽世;任一;任红燕 | 申请(专利权)人: | 上海美吉生物医药科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海晨皓知识产权代理事务所(普通合伙) 31260 | 代理人: | 成丽杰 |
地址: | 201314 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 一种用于对已知序列两侧未知侧翼序列测序的方法,包括构建文库、侧翼序列捕获及测序三部分。采用了定点突变PCR的方法,在已知序列上设计合适的引物(不需有突变位点),以构建的文库为模板,从文库中众多的质粒中筛选到含有已知序列位点的DNA片段,通过PCR方法在质粒库中筛选出靶位点,进而得到插入序列为2Kb-5Kb,含有已知序列的质粒库,并依此为靶点得到其两侧侧翼序列。本发明提供的测序方法实现了对基因组的全貌获取,解决了研究人员在对基因进行全面研究时无法对其全貌进行描述,进而无法精确研究其功能的技术限制,有利提高了相关研究的效率。 | ||
搜索关键词: | 用于 已知 序列 两侧 未知 侧翼 方法 | ||
【主权项】:
一种用于对已知序列两侧未知侧翼序列测序的方法,其特征是包括构建文库、侧翼序列捕获及测序三部分;所述的文库构建是将多聚核苷酸制成2Kb‑5Kb的片段后,连接到质粒载体,然后转入第一感受态细胞进行扩大培养,获得混合质粒库;所述的侧翼序列捕获是在未知序列附近的已知序列上设计PCR引物,并对混合质粒库进行扩增,并将消化的扩增产物转化入第二感受态细胞中,培养并获得克隆;测序是对获得克隆进行测序,并利用生物信息学的手段,捕获已知序列周围的侧翼序列。
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