[发明专利]碱基部保护寡核苷酸

摘要

本发明提供一种用于延伸的受保护核苷酸，其可通过液‑液萃取操作有效地和高收率地进行纯化，并且可通过亚磷酰胺法实现寡核苷酸制备方法。已经发现可通过特定的碱基部保护寡核苷酸和/或特定的3’位含支链的芳族保护寡核苷酸来解决上述问题。

主权项

碱基部保护寡核苷酸，其由通式(I)表示：式中，q表示0～49的任意整数；q+1个碱基2各自独立地表示被具有C5‑30直链或支链烷基和/或C5‑30直链或支链烯基的基团保护的核酸碱基；P1表示氢原子、二(C1‑6烷氧基)三苯甲基、或单(C1‑6烷氧基)三苯甲基；X表示氢原子、任选被保护的羟基、卤素原子、‑ORi、‑O‑NR37‑Rj、或‑O‑Rk‑O‑Rl，其中Ri为与4位交联的C1‑6亚烷基，Rj为与4位交联的C1‑6亚烷基，R37为氢原子或C1‑6烷基，Rk为C1‑6亚烷基，Rl为与4位交联的C1‑6亚烷基；q个X’各自独立地表示氢原子、任选被保护的羟基、卤素原子、‑ORi、‑O‑NR37‑Rj、或‑O‑Rk‑O‑Rl，其中Ri为与4位交联的C1‑6亚烷基，Rj为与4位交联的C1‑6亚烷基，R37为氢原子或C1‑6烷基，Rk为C1‑6亚烷基，Rl为与4位交联的C1‑6亚烷基；q+1个P2各自独立地表示由‑CH2CH2WG表示的基团，WG为吸电子基团；q个R34各自独立地表示氧原子或硫原子；Re和Rf各自独立地表示C1‑6烷基，所述具有C5‑30直链或支链烷基和/或C5‑30直链或支链烯基的基团为由式(k)表示的基团、由式(l)表示的基团、由式(m)表示的基团或者由式(s)表示的基团，所述式(k)为：式中，*表示与核酸碱基的键合位置；R27表示C5‑30直链或支链烷基或者C5‑30直链或支链烯基，所述式(l)为：式中，*表示与核酸碱基的键合位置；Q1表示‑O‑、‑S‑或‑NR30‑，式中R30表示氢原子或C1‑22烷基；Rc和Rd各自独立地表示氢原子或C1‑22烷基；R28表示C5‑30直链或支链烷基或者C5‑30直链或支链烯基，所述式(m)为：式中，*表示与核酸碱基的键合位置；l表示1至5的整数；l个Q2各自独立地表示单键，或者表示‑O‑、‑S‑、‑OC(=O)‑、‑C(=O)O‑、‑O‑CH2‑、‑NH‑、‑NHC(=O)‑、‑C(=O)NH‑、‑NH‑CH2‑或‑CH2‑；l个R29各自独立地表示C5‑30直链或支链烷基或者C5‑30直链或支链烯基；环C表示苯环或环己烷环，该苯环或环己烷环除了具有l个Q2R29和*C=O之外，进一步任选具有取代基，所述取代基选自卤素原子、任选被一个以上的卤素原子取代的C1‑6烷基、和任选被一个以上的卤素原子取代的C1‑6烷氧基，所述式(s)为：式中，*表示与核酸碱基的氨基形成亚氨基键的位置；R35和R36各自独立地表示C5‑30直链或支链烷基或者C5‑30直链或支链烯基。