[发明专利]通过应用参考基因组的分层结构使诧异数据最小的方法和系统

摘要

一种使诧异数据最小的方法、计算机程序产品、和计算机系统包含在源头上，计算机读取和识别生物体的基因序列的特性；接收生物体的基因序列的至少两种所识别特性的等级的输入；根据生物体的基因序列的至少两种所识别特性的等级生成分级的所识别特性的分层结构；将分级的所识别特性的分层结构与参考基因组的中心库相比较；以及如果来自中心库的至少一个参考基因组与分级的所识别特性的分层结构匹配，则将生物体的基因序列的核苷酸与来自至少一个匹配参考基因组的核苷酸相比较，以获取差异和创建诧异数据。

主权项

一种使诧异数据最小的方法，该方法包含如下步骤：a)在源头上，计算机读取和识别生物体的基因序列的特性；b)该计算机接收生物体的基因序列的至少两种所识别特性的等级的输入，该等级提供所识别特定特性的相对值、权重或重要性；c)该计算机根据生物体的基因序列的至少两种所识别特性的等级生成分级的所识别特性的分层结构；d)该计算机将分级的所识别特性的分层结构与参考基因组的中心库相比较；以及e)如果来自中心库的至少一个参考基因组与分级的所识别特性的分层结构匹配，则i)该计算机将至少一个匹配参考基因组存储在中心库中；ii)该计算机将生物体的基因序列的核苷酸与来自至少一个匹配参考基因组的核苷酸相比较，以找出生物体的基因序列的核苷酸与来自至少一个匹配参考基因组的核苷酸不同的差异；以及iii)该计算机使用该差异创建诧异数据并将该诧异数据存储在中心库中，该诧异数据包含参考基因组内该差异的开始地点、和与参考基因组的核苷酸不同的来自生物体的基因序列的核苷酸；如果来自中心库的另一个参考基因组与分级的所识别特性的分层结构匹配，则重复步骤(e)(i)、(e)(ii)、和(e)(iii)。