[发明专利]用于预测肽的免疫原性的系统和方法在审
申请号: | 201380039722.1 | 申请日: | 2013-03-14 |
公开(公告)号: | CN104487979A | 公开(公告)日: | 2015-04-01 |
发明(设计)人: | P·帕斯;F·J·阿斯瓦德 | 申请(专利权)人: | 拜尔健康护理有限责任公司 |
主分类号: | G06F19/10 | 分类号: | G06F19/10 |
代理公司: | 北京北翔知识产权代理有限公司 11285 | 代理人: | 张广育;姜建成 |
地址: | 美国新*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | 本发明提供了预测肽的免疫原性的系统、计算机可读存储介质和方法。在某些情况下,所述系统包含:a)肽的模型、MHCII蛋白的模型和T细胞受体的模型;和b)用于以下的可执行程序:(i)评估包含所述肽、所述MHCII蛋白和所述T细胞受体的复合物的分子间相互作用的强度以提供预测所述肽的免疫原性的得分;和(ii)输出所述得分。 | ||
搜索关键词: | 用于 预测 免疫原性 系统 方法 | ||
【主权项】:
一种包含存储器的计算机系统,所述存储器包含:a)肽的模型、MHCII蛋白的模型和T细胞受体的模型;和b)用于以下的可执行程序:(i)评估包含所述肽、所述MHCII蛋白和所述T细胞受体的复合物的分子间相互作用的强度以提供预测所述肽的免疫原性的得分;和(ii)输出所述得分。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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