[发明专利]一种金针菇F3菌种的SSR标记指纹图谱与应用有效
申请号: | 201410318267.5 | 申请日: | 2014-07-04 |
公开(公告)号: | CN104131086A | 公开(公告)日: | 2014-11-05 |
发明(设计)人: | 尚晓冬;陆欢;王瑞娟;章炉军;徐珍;张丹;谭琦 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人: | 黄志达 |
地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明涉及一种金针菇F3菌种的SSR标记指纹图谱与应用,该指纹图谱由6对基于金针菇基因组序列开发的SSR标记的特异等位片段组合而成。应用包括:对金针菇菌种进行SSR标记扩增,将得到的带型与指纹图谱对照,与该指纹图谱一致即为F3菌种。本发明与常规形态学检测、拮抗试验、出菇试验相比,具有检测时间短、准确性高、可重复性好的优点,在收集的我国24个主栽金针菇菌种中具有F3菌种的专一性。 | ||
搜索关键词: | 一种 金针菇 f3 菌种 ssr 标记 指纹 图谱 应用 | ||
【主权项】:
一种金针菇F3菌种的SSR标记指纹图谱,其特征在于:该指纹图谱由6对基于金针菇基因组序列开发的SSR标记的特异等位片段组合而成,6对SSR标记在金针菇F3菌种上扩增的等位片段信息具体为:Fv_fp0001的等位片段的数量为2,等位片段1相对于50bp DNA ladder的分子量为700bp;等位片段2相对于50bp DNA ladder的分子量为680bp;Fv_fp0002的等位片段的数量1,等位片段1相对于50bp DNA ladder的分子量为1300bp,Fv_fp0003的等位片段的数量为1,等位片段2相对于50bp DNA ladder的分子量为680bp;Fv_fp0004的等位片段的数量2,等位片段1相对于50bp DNA ladder的分子量为1250bp;等位片段2相对于50bp DNA ladder的分子量为1200bp;Fv_fp0005的等位片段的数量4,等位片段1相对于50bp DNA ladder的分子量为1100bp,等位片段2相对于50bp DNA ladder的分子量为800bp;等位片段3相对于50bp DNA ladder的分子量为530bp;等位片段4相对于50bp DNA ladder的分子量为500bp;Fv_fp0006的等位片段的数量为2,等位片段1相对于50bp DNA ladder的分子量为400bp;等位片段3相对于50bp DNA ladder的分子量为360bp。
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